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微生物特征
文章数:5篇
宏基因组
康禹团队:VTwins可从宏基因组数据中推断致病微生物特征
由于受到众多混杂因素的干扰,很难从高维宏基因组数据中推断出因果关系。近日,中科院北京基因组研究所康禹及团队在Science Bulletin发表最新研究,开发出VTwins工具(https://github.com/mengqingren/VTwins),发现VTwins在处理高多样性、高维组成数据方面简单有效,可从宏基因组数据中推断致病微生物特征,值得关注。
宏基因组
VTwins
研究论文
基础研究
微生物特征
饮食模式
不同饮食驱动下菌群差异的遗传变异有何规律?
肠道微生物群会受到饮食、宿主遗传学和性别影响的综合调节。这些影响的程度以及它们之间的相互作用对于理解肠道微生物群的个体间变异非常重要。近日,美国德州农工大学研究人员在Microbiome发表最新研究,通过动物实验结合不同饮食模式干预,发现性别、饮食和遗传背景对肠道微生物群的个体间差异有不同程度的影响。因此,通过整合遗传变异、微生物群和性别影响微生物群变异的精确营养,对于预测碳水化合物组成的不同饮食反应将是很重要的,值得关注。
饮食模式
遗传变异
研究论文
基础研究
基因座
艰难梭菌
陈启仪+秦环龙等:产丁酸菌减少或削弱粪菌移植的治疗效果?
大约10%诊断为艰难梭菌感染的个体表现出对粪菌移植的耐药性,其潜在机制尚不清楚。近日同济大学上海第十人民医院陈启仪、秦环龙、王新军及团队在Gut Microbes发表最新研究,通过粪菌移植人群试验,发现FMT非缓解型复发性艰难梭菌感染患者表现出阻碍有益丁酸菌定植的明显特征,值得关注。
艰难梭菌
产丁酸菌
研究论文
基础研究
粪菌移植(FMT)
肠脑轴
Nature子刊:自闭症患者相关分子和微生物有何特征?
人类肠道菌群已被证明在自闭症中发挥作用,但这种联系的机制仍充满不确定性。近日,西蒙斯基金会自闭症研究计划相关人员在Nature Neuroscience发表最新研究,开发出一种贝叶斯差异排序算法,重新分析25个先前发表数据集的ASD患者相关分子和分类特征,发现自闭症特有的代谢途径与特定肠道微生物有关,这些途径与大脑基因表达变化、限制性饮食模式和促炎细胞因子谱也相关,值得关注。
肠脑轴
微生物特征
研究论文
基础研究
代谢产物
机器学习
Nature子刊:数据驱动法或可用于预测药物对人类微生物组的影响?
先前多项研究发现药物会对肠道细菌产生负面影响,耗尽有益物种并造成不良反应,为了指导个性化药物治疗,需全面了解各种药物对肠道微生物组的影响。近日,特拉维夫大学研究人员及团队在Nature Communications发表最新研究,开发了一种数据驱动的方法,用于预测药物对人类微生物组的影响。系统地绘制了药物与人类肠道细菌间的大量相互作用,并证明药物的抗菌特性与其不良反应密切相关,值得关注。
机器学习
菌群药物互作
研究论文
基础研究
药物结构