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遗传变异
文章数:10篇
饮食模式
不同饮食驱动下菌群差异的遗传变异有何规律?
肠道微生物群会受到饮食、宿主遗传学和性别影响的综合调节。这些影响的程度以及它们之间的相互作用对于理解肠道微生物群的个体间变异非常重要。近日,美国德州农工大学研究人员在Microbiome发表最新研究,通过动物实验结合不同饮食模式干预,发现性别、饮食和遗传背景对肠道微生物群的个体间差异有不同程度的影响。因此,通过整合遗传变异、微生物群和性别影响微生物群变异的精确营养,对于预测碳水化合物组成的不同饮食反应将是很重要的,值得关注。
饮食模式
遗传变异
研究论文
基础研究
基因座
进化依赖
有些宿主为何对微生物群进化成瘾?(观点)
进化成瘾有时也被称为进化依赖,它可能发生在任何宿主系统中,从人类肠道到植物根系,再到寄生其他微生物的微生物。近日,加州大学欧文分校研究人员在Trends in Microbiology发表最新观点,在某些情况下,微生物实际上可能并没有帮助它们的宿主;相反,没有微生物的宿主可能会因为对微生物上瘾而出现功能障碍。在这种情况下,宿主依赖微生物来发挥功能,但微生物实际上并没有提供任何益处作为回报。
进化依赖
微生物
观点
基础研究
共生
肠道菌群
国内团队:肠菌遗传变异可影响果蝇的寿命、睡眠和运动表现
多项研究已经表明肠道菌群可以调节宿主的寿命和活动,包括睡眠质量和运动表现。但肠道菌群遗传变异在调节宿主表型方面的作用尚不清楚。近日,徐州医科大学朱作斌、广东省医学科学院王亮及团队在ISME发表最新研究,发现果蝇肠道中酿酒酵母CTA1基因的缺陷会增加活性氧的积累,降低果蝇的寿命和睡眠时长。通过使用强效活性氧清除剂硫辛酸盐治疗可以挽救这种效应,值得关注。
肠道菌群
果蝇寿命
研究论文
基础研究
宿主表型
转录延伸
Nature:与衰老相关的转录延伸变化会影响寿命?
在衰老过程中,动物转录组会经历广泛的重塑,转录本表达的大规模变化会影响信号传导、DNA损伤反应、蛋白质稳态、免疫反应和干细胞可塑性。目前尚不清楚转录过程本身是否或在多大程度上影响衰老或受衰老的影响。近日,德国科隆大学研究人员在Nature发表最新研究,通过对不同生物体(线虫、果蝇、小鼠、大鼠和人类)转录过程中与衰老相关的全基因组变化进行研究,发现通过饮食限制和降低胰岛素-IGF信号通路可逆转大多数与衰老相关的变化,值得关注。
转录延伸
寿命
研究论文
基础研究
全基因组
宏观多样性
MetaPop:探索微生物组宏观和微观多样性的工具
本研究中,作者介绍了 MetaPop,这是一种开源生物信息学流程,其提供了一个单一界面来分析和可视化宏观和微观多样性水平的微生物和病毒群落宏基因组。作者将 MetaPop 应用于接受粪便菌群转移的自闭症儿童及其神经正常同龄人的肠道病毒组,发现仅在宏观层面进行分析可能会遗漏重要的生物学差异。作者表示标准化的种群和遗传变异分析对于最大限度地进行生物学推断是非常宝贵的,而 MetaPop 提供了一个方便的工具包来探索菌群中宏观和微观多样性的双重影响。
宏观多样性
可视化
生物信息学
肠道病毒组
自闭症儿童
共生功能体
微生物驱动的共生功能体遗传变异(综述)
FEMS Microbiology Reviews发表的这篇综述,以肠道微生物组为主体,探讨了微生物在共生功能体(holobionts,由宿主及其微生物组组成)遗传变异中的驱动作用,认为从环境中获得新的微生物以及微生物之间的水平基因转移,是共生功能体中遗传变异和进化的主要模式。
共生功能体
遗传变异
进化
自闭症
刘星吟等:自闭症基因变异与肠道菌群的关系
自闭症谱系障碍(ASD)与肠道菌群和遗传因素都有关联。Gut Microbes近期发表了来自南京医科大学刘星吟团队的研究,重点分析了ASD相关的遗传变异与肠道菌群组成和功能之间的关系,为研究遗传与菌群的互作在ASD疾病机制中的作用带来新启示。
自闭症
肠道菌群
遗传变异
代谢
免疫
皮肤
患者的遗传背景或影响慢性伤口的菌群组成和愈合
PLoS Pathogens发表的文章,通过对2群队列的慢性伤口患者的遗传背景与伤口菌群进行关联性研究,发现TLN2和ZNF521的遗传变异会影响伤口中细菌数量和常见病原体丰度,进而影响伤口愈合。
皮肤
遗传变异
伤口菌群
伤口愈合
宿主-病原体互作
流感病毒提醒你该减肥了
肥胖已成为全球性“流行病”,全球50%的成年人超重或肥胖。肥胖会带来一系列健康风险,如导致II型糖尿病、代谢综合征、心血管疾病和各种癌症等,但肥胖的影响不止于此。《mBio》上的一项小鼠研究显示,当病毒在肥胖小鼠之间传播时,少量突变体在肥胖小鼠中迅速出现,并且表现出更强的复制能力,从而导致肥胖小鼠来源的病毒在感染野生小鼠时表现出更强的毒力。该研究表明肥胖微环境是导致流感病毒致病性增加的因素之一,为人们理解病毒进化和预防流感病毒感染提供了理论指导。
宿主-病原体互作
NHBE
influenza
interferons
Obesity
菌群全基因组范围相关性研究
Nature Reviews:人的基因突变如何影响肠道菌群和疾病?(综述)
这是Nature Reviews Genetics[IF:40.282]发出的关于人体自身遗传变异如何影响肠道菌群的结构并进而在疾病中发挥作用的重量级综述,特别推荐专业人士精读。
菌群全基因组范围相关性研究
遗传变异
Nod2