肠道病毒组

哮喘肠道病毒组

轻微肝性脑病（MHE）引起的认知功能障碍对肝硬化患者具有不利影响，需要更精确的治疗，然而目前大多数关于肝硬化和认知障碍中肠道菌群变化的研究主要集中在细菌上。近日，发表在Gut Microbes上的这篇文章，通过横断面和纵向方法确定肝硬化患者的个体认知测试结果与细菌/病毒组之间的联系。

肠-脑轴肠道病毒组肝性脑病肝硬化

纳米塑料

中国环科院：纳米塑料伤害鱼类肠道和大脑，维生素D或可减轻

先前多项研究已经调查了纳米塑料暴露如何通过失调的脑-肠轴互作介导神经和肠道毒性，但很少有报道探究如何减轻这些影响。近日，中国环境科学研究院吴丰昌、赵晓丽及团队在Microbiome发表最新研究，探究VD如何缓解纳米塑料暴露对其神经和肠道毒性的影响。高浓度VD可减少斑马鱼脑组织和肠组织的聚苯乙烯纳米塑料（PS-NPs）积累，增加5-HT含量进而缓解焦虑行为。总之，该研究表明维生素D在缓解由PS-NPs暴露引起的大脑-肠道-病毒组紊乱方面的潜力巨大，值得关注。

纳米塑料维生素D 研究论文基础研究肠道病毒组

结直肠癌

幽门螺杆菌感染增加结直肠癌风险与肠道病毒组有关

Gut近期发表的短篇文章，报道肠道噬菌体参与调控幽门螺杆菌感染诱导的结直肠癌的进展。在感染早期使用抗生素或可减少噬菌体对肿瘤发生的影响。

结直肠癌幽门螺杆菌肠道病毒组噬菌体

肠道噬菌体

左涛Nature Reviews：肠道噬菌体与宿主免疫（评论）

尽管长期以来肠道微生物一直被认为是了解宿主健康的基石，但肠道病毒组研究的领域是最近出现的。然而，肠道病毒体在人类中的功能作用在很大程度上尚不清楚。中山大学附属第六医院的左涛近期在Nature Reviews Microbiology发表评论文章，探讨了肠道病毒组里程碑意义的一些发现，这些具有里程碑意义的研究在机制上建立了肠道噬菌体和生物体水平上的哺乳动物免疫之间的直接功能关联。它为未来探索肠道噬菌体在真核哺乳动物宿主中的作用，特别是在疾病环境中奠定了研究的基础，并将为如何使用量身定制的噬菌体治疗慢性疾病提供理论基础。

肠道噬菌体宿主免疫尾病毒目噬菌体溃疡性结肠炎肠道病毒组

噬菌体

Nature子刊：分析人类肠道噬菌体的新工具Phanta

由于技术限制，大多数肠道微生物组的研究都集中在原核生物上，而忽略了病毒。近日，美国斯坦福大学研究人员在Nature Biotechnology发表最新研究，使用定制的基于k-mer分类工具并结合最近发布的肠道病毒基因组目录，开发了用于分析人类肠道噬菌体的新工具Phanta，在模拟和真实数据中性能表现良好，值得测试和关注。

噬菌体 Phanta 研究论文基础研究分析工具

肠道病毒组

粪便病毒组移植可提高小鼠肠道Akk菌增殖，并提高生育率

肠道病毒组在塑造肠道菌群中发挥着关键作用，而且粪菌移植（FMT）在治疗各种疾病中具有潜力，与FMT相比，粪便病毒组移植 (FVT)不会传播细菌，从而降低传播细菌相关传染病的风险，然而其对食用益生菌的作用尚不清楚。近日，发表在Gut Microbes上的这篇文章，发现FVT可提高小鼠肠道Akk菌（嗜黏蛋白阿克曼菌）增殖，并提高小鼠生育率。

肠道病毒组菌群移植 AKK菌益生菌生殖

幽门螺杆菌感染

Nature子刊：幽门螺杆菌感染患者治疗前后的肠道病毒组变化

Nature Communications上发表的一项最新研究结果，对比了幽门螺杆菌感染患者在接受抗生素治疗前后的肠道细菌及病毒组的变化。

幽门螺杆菌感染研究论文队列研究肠道病毒组

肠道病毒组

Nature子刊：健康婴儿的肠道病毒组

Nature Microbiology近期发表的文章，详细分析了健康婴儿肠道中的病毒组。研究中发现的病毒家族扩展了现有的噬菌体分类，并为未来的婴儿肠道病毒组研究提供了资源。

肠道病毒组健康婴儿病毒多样性

缺血性心脏病

iMeta：国内团队综述缺血性心脏病相关肠道微生物及菌群代谢物研究进展

本研究重点阐述了IHD（缺血性心脏病）发病相关的肠道菌群结构改变及其相应的代谢产物特征，以及针对肠道菌群紊乱的相应干预策略等。此外，对肠道病毒组在人类IHD等非传染性疾病的发生发展中所起的作用及其研究前景进行展望。

缺血性心脏病肠道微生态调控代谢产物粪菌移植肠道病毒组

克罗恩病（CD）

马延磊团队：克罗恩病患者的肠道病毒组失调

复旦大学的马延磊在Journal of Medical Virology发表文章，对比分析了克罗恩病发作期、缓解期及健康对照的肠道病毒组特征，为研究肠道病毒在克罗恩病的发病机制、精准诊断以及疾病状态中的作用提供参考。

克罗恩病（CD）肠道病毒组

肠道病毒组

马骁驰+鄢秋龙等：用肠道病毒组诊断大肠癌和腺瘤，潜力如何？（荟萃分析）

先前研究发现病毒是肿瘤发生的诱导剂，但很少有研究探讨肠道病毒组对结直肠癌进展的影响，并且在不同队列中病毒特征的可重复性较差。近日，大连医科大学的马骁驰、鄢秋龙及团队在Journal of Advanced Research发表最新研究，纳入9项已发表的结直肠癌和腺瘤研究（含1282个粪便宏基因组）用于组装病毒基因组，基于患者和健康人肠道内识别的差异噬菌体构建随机森林模型，发现可以较好地区分结直肠癌/腺瘤与健康人。总之，该研究证实了结直肠癌和腺瘤患者的肠道病毒群特征，并强调了结肠直肠癌进展中肠道噬菌体-细菌的协同作用，为未来结直肠癌治疗的提供了新靶点。

肠道病毒组预测性能荟萃分析基础研究结直肠癌

类风湿关节炎

国内团队：类风湿关节炎患者的口腔病毒组失调

大连医科大学的鄢秋龙团队与中国农业大学的Shenghui Li团队在Microbiology spectrum上发表的一项最新研究结果，对比鉴定了健康对照、未经治类风湿关节炎（RA）患者及经治RA患者的口腔及肠道病毒组差异，并发现经治RA患者的口腔病毒-细菌互作失调。基于口腔病毒和细菌的模型可较准确地区分健康对照、未经治RA患者及经治RA患者。

类风湿关节炎口腔病毒组肠道病毒组研究论文队列研究

肠道病毒组

UC患者来源的噬菌体可加剧结肠炎

肠道菌群是由细菌、病毒、古生菌和真菌组成的复杂微生物群落，之前研究表明IBD与肠道噬菌体群落具有相关性，但噬菌体对肠道细菌群落、肠道免疫反应和疾病进展是否有影响目前尚不清楚。近日发表在Microbiome的文章表明，与来自健康人的VLPs相比，UC VLPs可特异性地改变与IBD进展有关的几种细菌菌群的相对丰度，进而加剧DSS诱导的结肠炎。因此，噬菌体是肠道中细菌群落的动态调节剂，在调节肠道炎症和疾病方面发挥了作用。

肠道病毒组噬菌体溃疡性结肠炎

代谢综合征

Nature子刊：肠道病毒组或与代谢综合征有关？

噬菌体是人体微生物组中一个很重要的组成部分，肠道噬菌体的组成差异巨大，远大于其相对应细菌的组成差异。多项研究发现，肠道病毒群的改变与炎症性肠病、营养不良和2型糖尿病等疾病有关，但这些研究仍未能确定与此类疾病相关的特定病毒谱系。近日，发表在Nature Communications的研究探索了肠道病毒组与代谢综合征（MetS）间的关联，相比于健康人，发现MetS患者肠道中病毒丰度和多样性降低，侵染链球菌科和拟杆菌科的噬菌体富集。发现罗氏菌属病毒簇与MetS显著相关，Ca. Heliusviridae噬菌体似乎与人类健康密切相关。总之，该研究为未来进一步探究肠道病毒和特定疾病间的关联提供了新思路。

代谢综合征肠道病毒组研究论文基础研究噬菌体

NEC

Nature子刊：早产儿患NEC前，肠道病毒组有什么特征？

坏死性小肠结肠炎（NEC）是早产的一个严重后果，通常与肠道细菌微生物组的改变有关。然而，人们对早产儿肠道病毒组的发展或其在NEC中的作用知之甚少。Nature Microbiology近期发表的研究，纳入23名早产儿（包括9例后来发展成NEC的婴儿和14例与出生时胎龄和出生体重相匹配的对照组），对肠道病毒群进行纵向的宏基因组学研究。结果发现，在有NEC风险的婴儿中，不同年龄段的噬菌体和真核病毒的肠道病毒组都有很大的个体间差异。然而，在发生NEC之前，发生NEC的婴儿的病毒组β多样性水平降低，表明细菌和病毒的扰动在NEC的发生之前就发生了，提示早产儿生命早期的病毒组特征可能与NEC相关。

NEC 肠道病毒组早产儿

肠道病毒组

Science子刊：肠道病毒组调节肠道免疫稳态

Science Immunology上发表的一项最新研究结果，报道了IBD患者的肠道病毒组失调，且相比于非IBD个体的肠道病毒组诱导的抗炎先天性免疫应答，IBD患者的肠道病毒组可诱导炎性应答。另外，非IBD肠道病毒组可缓解，而IBD肠道病毒组可恶化DSS诱导的小鼠结肠炎。该研究结果提示，肠道病毒组可通过调节先天性免疫应答影响肠道稳态及IBD。

肠道病毒组研究论文队列研究啮齿动物（小鼠）基础研究

宏观多样性

MetaPop：探索微生物组宏观和微观多样性的工具

本研究中，作者介绍了 MetaPop，这是一种开源生物信息学流程，其提供了一个单一界面来分析和可视化宏观和微观多样性水平的微生物和病毒群落宏基因组。作者将 MetaPop 应用于接受粪便菌群转移的自闭症儿童及其神经正常同龄人的肠道病毒组，发现仅在宏观层面进行分析可能会遗漏重要的生物学差异。作者表示标准化的种群和遗传变异分析对于最大限度地进行生物学推断是非常宝贵的，而 MetaPop 提供了一个方便的工具包来探索菌群中宏观和微观多样性的双重影响。

宏观多样性可视化生物信息学肠道病毒组自闭症儿童

粪菌移植

左涛+兰平+吴小剑等Lancet子刊：详解FMT中的病毒组和真菌组（综述）

粪菌移植肠道病毒组肠道真菌组

肠道病毒组

张文+沈权：病毒宏基因组学分析揭示高原蜥蜴肠道病毒组

江苏大学张文、沈权等近期在Microbiology spectrum发表研究，首次揭示了高原蜥蜴肠道病毒组独特的结构和功能特征，为进一步研究这些濒危蜥蜴物种及其他变温动物和高原动物的肠道病毒组奠定基础。

肠道病毒组蜥蜴青藏高原 Qinghai-Tibet Plateau Bacteriophages

肠-脑轴

Cell子刊：肠道噬菌体可影响大脑功能

肠道微生物组参与影响认知功能，但肠道病毒组（主要由有尾噬菌体目和微小噬菌体科的噬菌体组成）在其中的作用尚待挖掘。Cell Host and Microbe最新发表的研究在这一问题上取得了新进展，通过人群队列分析以及小鼠和果蝇实验表明，肠道噬菌体在菌群-脑轴中有不可忽视的作用。

肠-脑轴噬菌体肠道病毒组认知记忆

肠道病毒组

Cell子刊：人肠道中的crAss样噬菌体

肠道病毒组 crAss样噬菌体研究论文队列研究 IBD

疫苗应答

Cell子刊：轮状病毒疫苗效果不佳，可能是肠道病毒组在干扰

轮状病毒疫苗（RVV）大大降低了严重轮状病毒胃肠炎的死亡率，但RVV在中低收入国家的效果明显较差，其原因尚不清晰，肠道微生物组或在其中发挥作用。Cell Host and Microbe发表的一项最新研究，通过宏基因组学测序，探索了非洲加纳的122名婴儿的肠道细菌和病毒组与RVV免疫效果（接种后的血清抗轮状病毒IgA转阳情况）之间的关系。研究者认为，中低收入国家的婴儿可能比高收入国家的婴儿，更早、更多样化地感染了肠道病毒，从而限制了RVV的效果。

疫苗应答肠道病毒组肠道微生物组口服轮状病毒疫苗

噬菌体-菌群-免疫互作

肠道噬菌体与菌群的互作，或影响自身免疫病

Annals of the Rheumatic Diseases上发表的一项病例-对照研究结果，对476名日本受试者的肠道病毒组进行分析后发现，crAss样噬菌体的丰度与类风湿关节炎（RA）及系统性红斑狼疮（SLE）相关，而短尾噬菌体科的丰度与SLE相关。另外，短尾噬菌体科与粪杆菌属之间存在共生关联，而后者产生的短链脂肪酸具有抗炎活性。该研究结果提示，肠道病毒组可能通过与肠道细菌的互作影响自身免疫疾病的发生发展。

噬菌体-菌群-免疫互作研究论文基础研究自身免疫疾病噬菌体

肠道病毒组

研究肠道病毒组的新资源+一种普遍存在的新噬菌体

mSystems近期发表一项来自丹麦的研究，报道了基于当地人群的肠道病毒组数据库，并从中发现了一种在全球人群中存在较为普遍的新的噬菌体。

肠道病毒组噬菌体

噬菌体疗法

肝病的肠道病毒组变化及噬菌体疗法（综述）

Journal of Hepatology上发表的一篇综述文章，详细介绍了肝病患者的肠道病毒组变化，并概述了致病细菌在多种肝脏疾病中的潜在作用，同时讨论了通过噬菌体疗法靶向特定致病细菌以治疗肝病的潜在可能。

噬菌体疗法综述肠道病毒组肝脏疾病

肠道病毒组

肠道病毒组与IBS、饮食和肠道基因表达的互作

肠道病毒组中包括感染宿主细胞的真核病毒以及感染细菌的噬菌体，可以塑造肠道细菌群落和引发宿主应答。Gastroenterology发表的一项最新研究，分析了健康人、便秘型肠易激综合征（IBS-C）和腹泻型肠易激综合征（IBS-D）患者的肠道病毒组，及其与其他组学数据的关系。该研究表明，肠道病毒组在短期内是稳定的，但在不同IBS亚型中存在差异，它受到饮食的影响，并可能通过与肠道细菌的相互作用和/或改变宿主的基因表达，来影响宿主功能。

肠道病毒组肠易激综合征

肠道病毒组

国内团队：肥胖及2型糖尿病患者的肠道病毒组变化

香港中文大学的黄秀娟团队与昆明医科大学附属第一医院的缪应雷团队在Gastroenterology上发表的一项最新研究，对比分析了肥胖者与非肥胖者的肠道病毒多样性及组成差异，并发现2型糖尿病+肥胖显著减弱了细菌-病毒互作。

肠道病毒组研究论文基础研究肥胖 2型糖尿病

肠道病毒组

Cell子刊：人肠道病毒组的稳定性和无麸质饮食的影响

Cell Reports近期发表的研究聚焦人肠道病毒组，分析了其组成、动态变化、个体差异和稳定性，特别探索了无麸质饮食对肠道病毒组的影响，并对研究方法进行了探讨。

肠道病毒组饮食干预

肠-脑轴

脊髓损伤改变小鼠肠道细菌及病毒的组成及功能

肠-脑轴研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）脊髓损伤