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文章数:1篇
扩增子
苏晓泉+徐健:在整个菌群水平上对全球菌群进行物种分类和功能搜索的平台
基于搜索的策略对于大规模挖掘微生物组数据集非常有用,例如鸟瞰菌群数据空间和通过菌群大数据进行疾病诊断。青岛大学苏晓泉和中科院青岛能源所徐健研究团队,近期在mSystems发表文章,介绍了微生物组搜索引擎2 (Microbiome Search Engine 2, MSE 2),这是一个微生物组数据库平台,基于菌群与数据库中菌群的分类或功能相似性,在全球宏基因组数据中搜索和查询菌群。关键的改进包括数据库扩展,数据兼容性,搜索引擎内核和用户界面。通过功能相似性搜索菌群空间的新功能极大地扩展了菌群大数据基于搜索的挖掘范围。
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