专家动态 | 刘永鑫

刘永鑫/陈同：FoodMicroDB——用于食物微生物组成和时间序列研究的微生物组数据库

中国农业科学院深圳农业基因组研究所刘永鑫团队和中国中医科学院国家中药资源中心陈同与团队发表研究，构建了一个具备丰富数据分析和可视化功能的食物微生物组数据库，收集了来自62种食物的108个扩增子测序项目数据，促进了食物微生物组数据的可访问性和可重用性，为该领域提供了一个有价值的资源平台。

2024-11-16

刘永鑫+范晓飞等Cell子刊：DeepMetagenome助力解析环境微生物组蛋白质多样性

深圳农业基因组研究所刘永鑫、遗传发育所农业资源研究中心Xin Zheng和和河北农业大学范晓飞等在Cell Reports Methods发表最新研究，开发出一种基于深度学习的工具DeepMetagenome，用于从环境微生物组中准确注释特定蛋白质家族，显著提高了金属硫蛋白等蛋白质的识别数量和准确性。

2024-11-09

陈同/黄璐琦/刘永鑫等：ImageGP 2.0——用于生物医学研究的强大数据可视化与可重复性分析工具

中国中医科学院黄璐琦、陈同和中国农科院深圳基因组所刘永鑫等团队发表文章，发布了在线数据可视化和生信分析平台ImageGP的升级版ImageGP 2.0（https://www.bic.ac.cn/BIC/#/），引入了最新网络开发技术，重新设计了用户使用界面，大大丰富和增强了原有功能，并显著改善了用户使用体验。

2024-10-19

刘永鑫团队：纳米孔测序——青春正盛，未来可期（综述）

中国农业科学院深圳农业基因组研究所/大鹏湾实验室刘永鑫团队发表综述，系统阐述了纳米孔测序技术在过去十年的发展、应用及前景，总结了该技术的重大进步，特别是国产纳米孔测序平台的发展，介绍并展望了纳米孔测序在科学研究中的广泛应用及重要意义。

2024-09-25

日报3000期 | 刘永鑫：我与《热心肠日报》共同成长

《热心肠日报》伴随我加入微生物组领域的8年，我坚信，未来是星辰大海，未来总是未可知，坚持做一件事并持之以恒，就是最优秀的品质，就一定会获得成功！

2024-09-11

李有贵/吴崇明/刘永鑫：肠道菌群—芳香烃受体轴介导桑黄多酚抗结肠炎作用

浙江省农业科学院李有贵、天津中医药大学吴崇明和中国农科院深圳基因组所刘永鑫等团队发表研究，表明桑黄多酚（SH）通过调节肠道菌群有效减轻模型小鼠的结肠炎病理症状，揭示了基于SH和肠道菌群之间的相互作用开发结肠炎治疗策略的潜在途径。

2024-07-31

黄璐琦/刘永鑫/陈同等：最全可视化韦恩图和集合图工具EVenn使用手册

中国中医科学院黄璐琦、陈同和中国农科院深圳基因组所刘永鑫与团队发表文章，概述了EVenn的各种应用。

2024-04-25

刘永鑫等：专为宏组学数据设计的用户友好型在线分析平台

中国农业科学院深圳农业基因组研究所刘永鑫团队发表研究，开发了宏组学数据分析平台——微科盟生科云（Wekemo Bioincloud），该平台提供了全面的分析解决方案，方便用户在处理大量组学数据中选择适用的工具。

2024-02-28

刘永鑫+袁军等：如何用好R进行微生物组分析？（综述）

如何从众多R包中选择合适、高效、便捷、易学的工具，是微生物组研究者面临的难题。中国农科院刘永鑫、南京工业大学袁军与团队在Protein & Cell 2023肠道大会微生物组专刊中发表综述文章，系统地梳理了R包在微生物组研究中的应用，为今后开发更好的微生物组工具提供了重要的理论基础和实践参考。本文干货很多，推荐专业人士学习参考。

2023-05-19