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群落构建
文章数:4篇
生态网络分析
iMeta:中科院邓晔组发布菌群网络分析平台iNAP
作者开发了一个可用于菌群研究中生成和分析生态网络的在线分析平台iNAP,其提供多种网络分析方法和工具,可以用于推断微生物域内及域间物种的关联,并可用于探究网络拓扑结构属性与环境驱动因子间的关系,从而帮助研究人员更好地了解菌群构建机制。iNAP 可在 http://mem.rcees.ac.cn:8081 免费使用,且作者在Github(https://github.com/yedeng-lab/iNAP)也提供了本地化运行SparCC、LSA和SPIEC-EASI的计算流程。
生态网络分析
菌群研究
随机矩阵理论
网络拓扑结构
群落构建
系统发育保守性
西北农林科技大学团队发表生态位的系统发育保守性决定土壤古菌地理格局
作者探究了中国西北部河西走廊地区五种不同生态系统中(农田、森林、湿地、草原和荒漠)土壤古菌生态位的系统发育保守性与其地理分布、群落组装和物种共存之间的联系。使用高通量测序对土壤古菌群落进行了分析,测定基本土壤理化因子,并根据采样点的地理坐标得到年降雨等气候变量。这项研究表明生态位的系统发育保守性与古菌的地理分布、群落组装过程和物种共存的平衡存在紧密联系,为全球变化背景下预测古菌的进化适应性奠定基础。
系统发育保守性
群落构建
古菌生态位
零模型
确定性过程
群落构建
北大陆雅海组揭示群落构建过程的平衡介导农田土壤微生物群落物种共存
理解生物多样性的产生和维持是生态学的关键主题。目前,对于群落构建过程与微生物生态系统共发生物种的生态策略之间的关系仍然缺乏足够的了解。北大陆雅海组的博士后焦硕在ISME发表文章,揭示了不同生境和区域农业生态系统土壤微生物群落构建与物种共存生态策略之间的联系,可促进农业生态系统微生物群落的管理,基于重组和共现过程的恢复策略,以更好地应对生境破碎和气候变化。
群落构建
农业微生态
真菌
细菌
古菌
生物多样性
Nature综述:真菌的生物多样性,超乎想象!
真菌的生物多样性,有什么特点,可以从哪些维度评估?Nature Reviews Microbiology这篇综述阐述得很清楚,推荐阅读。
生物多样性
生物多样性维度
真菌
真菌组
遗传多样性