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菌群网络
文章数:3篇
肠道菌群标志物
赵方庆等Nature子刊:拨开菌群大数据的迷雾,用NetMoss鉴定可靠的疾病标志物
肠道菌群作为疾病的“晴雨计”,是潜在的疾病标志物。然而,由于混杂因素(比如批次效应)以及基于丰度分析方法的局限性,不同研究之间难以鉴定出统一的疾病相关菌群标志物,这阻碍了菌群在疾病临床诊断和预后预测中的应用。为解决这一难题,中国科学院北京生命科学研究院的赵方庆团队,开发了一个基于生物学网络分析的新型工具——NetMoss,可以有效地解决以往微生物组数据整合中存在的批次效应问题,能极大提高对疾病相关肠菌标志物的识别能力。相关成果已在Nature Computational Science发表,强烈推荐专业人士关注!
肠道菌群标志物
分析工具
colorectal cancer
Data integration
data mining
非酒精性脂肪肝病
程蜀琳+陈洛南+张晨虹:脂肪肝患者肠道菌群网络对运动和饮食干预的响应
运动和饮食干预是治疗非酒精性脂肪肝病(NAFLD)的方法,然而,运动和饮食干预如何影响患者的肠道菌群?目前还存在很多未知。Nature Communications最新发表了来自上海交通大学运动转化医学中心程蜀琳团队、中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈洛南团队与上海交通大学生命科学技术学院张晨虹团队的合作研究成果,通过开展随机对照试验对这一问题进行了探索,揭示了运动和饮食干预对NAFLD患者肠道菌群网络的影响,以及菌群网络用于预测个体干预效果的潜力,为NAFLD的个性化治疗带来了新启示。
非酒精性脂肪肝病
肠道菌群
菌群网络
菌群调控
哈佛刘洋彧团队:找出最小驱动物种,撬动整个菌群
菌群中的微生物存在复杂的生态学联系,导致如何控制菌群是一门很“高深”的学问。而为了利用菌群造福人类,我们需要做到这一点。刘洋彧最新研究成果利用菌群生态网络计算最小驱动物种,理论上实现了对菌群状态的精确控制。对于这样一个理论研究,小编是一头雾水。敬请关注“热心肠先生”公众号独家专访中,刘老师本人的详细解读。
菌群调控
计算生物学
菌群网络
微生物生态系统
微生物生态学