肠道菌群标志物

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肠道菌群标志物

文章数：11篇

肠道菌群标志物

赵方庆等Nature子刊：拨开菌群大数据的迷雾，用NetMoss鉴定可靠的疾病标志物

肠道菌群作为疾病的“晴雨计”，是潜在的疾病标志物。然而，由于混杂因素（比如批次效应）以及基于丰度分析方法的局限性，不同研究之间难以鉴定出统一的疾病相关菌群标志物，这阻碍了菌群在疾病临床诊断和预后预测中的应用。为解决这一难题，中国科学院北京生命科学研究院的赵方庆团队，开发了一个基于生物学网络分析的新型工具——NetMoss，可以有效地解决以往微生物组数据整合中存在的批次效应问题，能极大提高对疾病相关肠菌标志物的识别能力。相关成果已在Nature Computational Science发表，强烈推荐专业人士关注！

肠道菌群标志物分析工具 colorectal cancer Data integration data mining

移植物抗宿主病

肠道菌群变化或可用于预测急性移植物抗宿主病的风险

来自Blood上发表的一项前瞻性观察性研究，在100名接受同种异体造血干细胞移植（allo-HSCT）的患者中发现，粪便菌群的α-多样性及组成的特定变化与急性移植物抗宿主病（GvHD）的风险显著相关，提示粪菌移植等菌群干预手段或可用于预防急性GvHD的发生。

移植物抗宿主病急性移植物抗宿主病同种异体造血干细胞移植生物标志物研究论文

是敌是友？于君等详述肠道菌群在癌症治疗中的作用（综述）

越来越多的证据显示，调节肠道菌群具有提高抗癌药物疗效的潜力。来自香港中文大学的于君研究团队在Gut发表最新综述文章，讨论了有关肠道微生物群在癌症治疗中的作用，并介绍了可用于靶向特定致癌细菌的方法和技术。

癌症肠道菌群化疗药物免疫检查点抑制剂益生菌

生命早期肠道菌群标志物可预测牛犊腹泻

早期肠道微生物群落的紊乱会对宿主健康产生长期影响。抗菌剂被广泛用于预防和治疗常见的传染性疾病。已有研究表明，抗菌剂对早期生命微生物群的干扰对小鼠和人类婴儿的宿主免疫功能有长期的负面影响，包括免疫缺陷或对病原体定植的易感性增加，但是对反刍动物的相关研究较少。发表在The ISME Journal上的一项研究对健康、腹泻和抗菌剂治疗牛犊进行了肠道菌群比较分析，表明可以根据特定的肠道菌群标志物来预测腹泻的发生，或可使用益生菌或益生元干预生命早期肠道菌群来提高宿主健康并减少抗菌剂的使用。

腹泻肠道菌群微生物组多样性 16s rRNA测序肠道菌群标志物

非酒精性脂肪性肝病

Nature Reviews：NAFLD的肠道菌群标志物（综述）

发表在Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology上的综述性文章。文章指出了寻找与非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）相关菌群标志物的意义，以及现有研究结果所呈现的共有结论（菌群和菌群代谢物），并指出了非一致结论产生的原因。未来的研究应该将这些影响菌群的因素考虑在内，也要考虑其在临床上的应用性。一些高新技术手段，比如深度学习和多组学技术，将助力菌群标志物的研究与发现。

非酒精性脂肪性肝病肠道菌群标志物 microbiota non-alcoholic fatty liver disease Zirun Jin

港中大团队：我国南方人肠道菌群中常见多种梭杆菌，或与大肠癌有关

梭杆菌属中，具核梭杆菌在结直肠癌（CRC）中富集，FadA黏附素可能介导了这种细菌对CRC的促进作用。Gut近期发表的来自香港中文大学团队的研究发现，我国南方人群的肠道菌群中，多个梭杆菌属细菌类群都比在其它人群中更为常见，含量和多样性也更高，并且从可变梭杆菌（F. varium）和溃疡梭杆菌（F. ulcerans）等多个梭杆菌菌种中，鉴定出FadA同系物的存在，或许与CRC相关。这些发现不仅扩充了与CRC有潜在关联的肠道细菌种类，也揭示出不同人群中梭杆菌属细菌的分布和多样性差异，再次提示基于菌群类群特征的诊断和治疗方法需要针对不同人群进行“量身定制”。

梭杆菌属结直肠癌肠道菌群标志物肠道菌群中国人群

双相情感障碍

王刚+谢鹏+胡少华等：或能区分单相和双相抑郁症的肠道菌群标志物

对于重度抑郁症（MDD）和双相情感障碍（BD）患者来说，准确的诊断是正确治疗的前提，但由于两种疾病存在重叠的症状，临床上往往容易出现误诊，从而耽误治疗。首都医科大学北京安定医院王刚团队、重庆医科大学第一附属医院谢鹏团队和浙江大学医学院第一附属医院胡少华团队等合作，近日在Advanced Science发表研究，通过分析对比MDD、BD和健康人的肠道菌群组成，鉴定出可用于区分MDD和BD的菌群特征标志物，为这两种疾病的临床诊断提供新途径。

双相情感障碍重度抑郁症肠道菌群标志物菌群-肠-脑轴 Joseph L Ward

肠道菌群标志物

梁巧仪+于君：结直肠癌和腺瘤无创诊断的粪菌新标志物

肠道菌群可用于检测结直肠癌，但目前仍缺少癌前阶段的无创诊断标志物。香港中文大学梁巧仪和于君与团队在Gut发表的一项最新研究，鉴定出可用于结直肠腺瘤无创诊断的粪菌标志物——某Lachnoclostridium细菌的基因标志物“m3”，并与其它基于粪便的腺瘤检测方法进行的对比。相关发现具有临床应用前景，值得专业人士关注。

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寻找与CRC、IBD相关肠道菌群基因的新方法

分析共丰度基因群（ CAG）有助于简化从基因层面研究菌群的方法。近期《Microbiome》发表一种新的数据处理方法，将CAG作为基础单位进行基因水平的菌群分析，并用该方法验证了一系列结直肠癌、炎症性肠病人群研究中与疾病相关的CAG。该数据计算方法有助于在基因层面揭示肠道菌群与人体健康的关系。

丰度基因肠道菌群标志物方法学结直肠癌炎症性肠病(IBD)

肠道菌群标志物

Nature子刊：粪便菌群的定量分析，揪出疾病相关的菌群标志物

菌群与疾病的相关性研究中，需要特别注意混杂因素，比如很多与肠道失调相关的疾病都伴随粪便硬度的改变，相关菌群变化（特别是微生物载量）在很大程度上反映的可能是粪便含水量。《Nature Microbiology》近期发表的一项研究，发现与原发性硬化性胆管炎（PSC）和/炎症性肠病（IBD）相关的特定肠型，与菌群细胞计数、粪便含水量和炎症标志物存在关联，并通过定量分析绝对丰度+对粪便含水量进行变量控制，清晰的找出与胆管炎和肠道炎症分别相关的标致菌属，对于分析疾病相关菌群标志物很有参考意义。

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肠道菌群标志物

慢性阻塞性睡眠呼吸暂停相关菌群和代谢标志物

用肠道菌群标志物来鉴定疾病状态，最主要的挑战之一是标志物是否在不同模型/个体间具有可重复性。mSystems发表的一项研究，在两种心血管疾病小鼠模型中通过随机森林方法，鉴定出与间歇性缺氧和高碳酸血症暴露（模拟慢性阻塞性睡眠呼吸暂停）相关的通用菌群和代谢组标志物，为疾病相关菌群标志物的鉴定带来启示。

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