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Ehsan Khafipour
文章数:7篇
微生物组数据质量控制
微生物组研究中如何进行质量控制?
微生物组研究中很少报道严格的质量控制对数据分析结果可重复性的评估。Microbiome发表的文章,提出了一个深入的循序渐进的方法框架,利用该策略,可对低生物量微生物组进行全面的质量控制。
微生物组数据质量控制
Decontam
批次差异
试剂污染物
可重复性
母乳菌群
Cell子刊:影响母乳菌群的多种因素
母乳中的菌群对塑造婴儿肠道菌群具有重要作用。 本研究发现了一系列与母乳菌群结构相关的影响因素,强调了婴儿性别对母乳菌群结构的影响,指出婴儿口腔菌群也可能反过来影响母乳菌群,此外,用吸奶器泵出可影响母乳菌群、增加潜在致病菌。该结果对研究婴儿健康和发育具有参考价值。
母乳菌群
breastmilk
human milk
Breastfeeding
microbiota
牛奶菌群
BoLA基因多态性对牛奶菌群的影响
Microbiome上发表的一项最新研究,分析了牛主要组织相容性复合体(BoLA)的基因多态性对奶牛产犊后第一周的牛奶菌群的影响,发现BoLA主要影响了初乳菌群的组成。
牛奶菌群
Bovine major histocompatibility complex (BoLA) gene
Mastitis
Milk microbiota
牛主要组织相容性复合体(BoLA)
儿茶酚抑素
FM:人体儿茶酚抑素改变小鼠的肠道菌群组成
这项研究关注儿茶酚抑素怎样改变小鼠肠道菌群,值得一读。
儿茶酚抑素
肠道菌群
Tsuyoshi Miki
Tsuyoshi Miki
围产期
FM:奶牛瘤胃菌群在围产期会发生什么变化?
这两篇文章推荐关注瘤胃菌群的人必读。
围产期
瘤胃菌群
饮食变化
生产参数
Lee M Kaplan
瘤胃酸中毒
亚急性瘤胃酸中毒对瘤胃菌群及上皮组织的影响
① 亚急性瘤胃酸中毒(SARA)对乳品加工业影响严重; ② 奶牛的瘤胃样品被分为液体及固体部分以分析菌群组成; ③ 厚壁菌门在瘤胃固定样本中占多数,但SARA使其丰度下降; ④ SARA使拟杆菌门丰度上升; ⑤ SARA使瘤胃上皮组织中CLDN1及CLDN4表达上升。
瘤胃酸中毒
瘤胃菌群
Daniel Commane
Ian Rowland
卡拉胶
乳猪IBD模型中,细菌对肠粘膜有何影响?
① 卡拉胶引起的IBD导致肠道菌群种类减少以及组成改变; ② 变形菌门和脱铁杆菌门增加,厚壁菌门、放线菌门和拟杆菌门减少; ③ 肠道菌群代谢活性也发生改变; ④ 黏着入侵的大肠杆菌则对肠道菌群没有显著影响。
卡拉胶
肠道菌群
IBD
大肠杆菌