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可重复性
文章数:9篇
人类菌群
人类肠道菌群宏基因组测序中DNA提取和文库构建方法的验证和标准化
高通量测序菌群测量方法的验证和标准化是支持人类菌群研究及其工业化的必要条件。该研究旨在建立基于标准的解决方案,以提高基于宏基因组学的人类粪便样本菌群分析的准确性和可重复性。本研究中提供的经验证的DNA提取和文库构建方案和方法学指导,拓展了目前人类粪便菌群宏基因组分析的最佳实践。采纳本研究的实验方法和指南将提高基于宏基因组学的人类菌群研究的准确性和可比性,从而促进基于人类菌群产品的开发和商业化。
人类菌群
宏基因组
肠道菌群
标准化
准确性
微生物组数据质量控制
微生物组研究中如何进行质量控制?
微生物组研究中很少报道严格的质量控制对数据分析结果可重复性的评估。Microbiome发表的文章,提出了一个深入的循序渐进的方法框架,利用该策略,可对低生物量微生物组进行全面的质量控制。
微生物组数据质量控制
Decontam
批次差异
试剂污染物
可重复性
可重复性
动物房对小鼠菌群研究可重复性的影响
Frontiers in Microbiology近期发表一项重复性研究,表明不同动物设施可严重影响实验小鼠的菌群组成,从而对菌群-疾病相关性研究结论的可重复性造成干扰,提示菌群研究中在不同动物设施进行重复实验的重要性。
可重复性
小鼠菌群
M Eric Gershwin
Howard A Young
Heekyong R Bae
可重复性
微生物组研究需标准化(综述)
Drug Discovery Today上发表的一篇综述,介绍了在微生物组研究中可能造成误差的原因,并探讨了如何将研究中的各个步骤标准化,以获得可重复性较好的结果。
可重复性
Christine Till
Rivka Green
可重复性
菌群研究中的可重复性问题及解决方法
微生物组研究火热,伴随而来的研究可重复性问题也受到越来越多的重视。mBio近期发表一篇观点文章对此进行讨论,提出了用于鉴别和解决可重复性问题的框架方针,推荐专业人士关注。
可重复性
研究伦理学
American Academy of Microbiology
Microbiome
Reproducibility
宿主-菌群互作
Immunity:NLRP6对多样性高的菌群有影响
Nlrp6炎性小体到底能不能影响菌群?多项研究得出矛盾结论。为了辩明这一问题,本周Immunity[IF:22.845]背靠背发表了两篇letter,正反方各自陈述观点,焦点主要集中在实验方法上。茶余饭后不妨围观一下牛人之间如何进行学术探讨(优雅的吵架)。另一篇见此(http://www.xunludkp.com/papers/read/1059146283)
宿主-菌群互作
可重复性
实验设计
炎性小体
菌群多样性
菌群-宿主互作
Immunity:Nlrp6炎性小体对菌群的影响缺少普适性
Nlrp6炎性小体到底能不能影响菌群?多项研究得出矛盾结论。为了辩明这一问题,本周Immunity[IF:22.845]背靠背发表了两篇letter,正反方各自陈述观点,焦点主要集中在实验方法上。茶余饭后不妨围观一下牛人之间如何进行学术探讨(优雅的吵架)。另一篇见此(http://www.xunludkp.com/papers/read/1041165333)
菌群-宿主互作
可重复性
实验设计
同窝对照
炎性小体
宏基因组
Gigascience:宏基因组学研究流程如何标准化?
宏基因组学的研究发展特别是成熟的时间并不长,为此很多方法学并不统一。这篇Gigascience上的文章,呼吁研究者采用更加一致的分析方法和工作流程,很有实际意义!PS,Gigascience是华大基因主办的开放期刊,很赞是不是?
宏基因组
元数据
可重复性
采样
测序
实验动物
Science:菌群可能颠覆小鼠实验的结果和可重复性
周五Science中最值得每一个研究者必读的文章,不解释,必看!
实验动物
方法学
可重复性
Catriona S Bradshaw
Catriona S Bradshaw