全基因组代谢网络重建

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全基因组代谢网络重建

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华中科技大学：解读肠道病变中的菌群互作

物种间对现有资源的竞争和合作相互作用很大程度决定了肠道菌群组成。华中科技大学的陈卫华团队近期在《Frontiers in Microbiology》发表研究，重新分析了3项肠道病变研究中的菌群代谢互作，阐释了多种新型的细菌类群互作模式，对于解读肠道病变中的菌群变化模式具有参考价值。

菌群互作方法学全基因组代谢网络重建炎症性肠病结直肠癌(CRC)

菌群代谢行为预测

Cell子刊：预测菌群的代谢行为

菌群内部复杂的种间互作带来了菌群的“涌现性”特征，很难通过对单一物种的认识预测此类特征。因此，理解种间互作的机制是我们能够改造、设计菌群，并将其用于治疗疾病或工业生产的前提条件。Cell Systems上发表的这篇论文，介绍了一个恒定产量预期（ConYE）模型，可根据单一物种代谢谱及其共培养时的生长情况，预测共培养体系的代谢行为。这相当于根据初始状态和极少量的后续状态参数，预测后续状态的具体行为。可以说在预测菌群代谢行为方面前进了关键的一小步。

菌群代谢行为预测全基因组代谢网络重建小鼠菌群共培养代谢组