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文章数：4篇

Cell：工业化加速了人肠道菌群中的基因转移

工业化影响了人类肠道生态系统，改变了微生物的组成和多样性。细菌基因组是否也能适应宿主种群的工业化，目前尚不清楚。Cell最新发表的文章，通过对工业化和非工业化地区的15个人群的肠道细菌进行分析，发现基因的水平转移（HGT）在近几代宿主的肠道菌群中积累，发生频率很高，而且工业化的生活方式与较高的HGT比率有关。即肠道细菌在适应宿主生活方式的基础上不断获得新的功能，较高速率的HGT可能与人类历史中工业化发展有关。

肠道细菌基因水平转移工业化 human gut microbiome Industrialization

人体菌群培养

人体菌群培养最新进展（综述）

发表在Clinical Microbiology Reviews上的综述性文章。针对人体微生物的研究，文章综述了现有的分离、培养方法，所用相关技术及最新研究进展；并在此基础上，指出人体微生物中细菌、古菌和真菌研究分别面临的挑战。为人体微生物相关研究课可能的微生物治疗提供相关理论依据。

人体菌群培养 culture strategies Human microbiota bacteria Archaea

找出抑制艰难梭菌的肠道共生菌

尽管粪菌移植是治疗艰难梭菌感染的有效方法，但用特定的肠道共生菌组合来抑制艰难梭菌可能是更为安全可控的疗法。mSystems发表的一项研究按照这一思路，结合使用培养组学和表型分析等方法，鉴定出在体外能抑制艰难梭菌生长的66种人类肠道共生细菌。值得注意的是，这些抑制菌的不同组合对艰难梭菌生长能起到不同的作用，有些组合甚至能促进艰难梭菌生长，提示在搭配细菌组合时，群落整体可能产生新的功能和性状。这些发现对于研究多菌株微生态疗法，具有参考意义。

定植抵抗 Clostridium difficile coculture colonization resistance culturomics

CID：培养组学的创立者和团队，硕果累累！

这是培养组学的引领者Didier Raoult和团队报告给全世界的重要成绩！利用培养组学这一强大工具，他们培养了许许多多已知和未知的细菌、古细菌、巨型病毒、真菌等等微生物，在2016年发表在Nature Microbiology的震惊菌群界的惊世骇俗研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1045515144）之后，他们系统性报告了团队进展，依然很让人兴奋，特别推荐！

人类菌群培养基因组巨型病毒 16S rRNA基因扩增和测序质谱分析