Embriette R Hyde

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文章数：7篇

代谢组学-全菌群相关性研究

AC：用好质谱，让代谢产物与对应菌群的研究更靠谱！

这是一项利用质谱技术研究菌群代谢产物和相对应细菌之间关联的研究，关于质谱的文章我们分享得不多，这篇一定特别推荐下，建议感兴趣的人精读。

代谢组学-全菌群相关性研究 Zhengzhi Liu Kangning Ren

Microbiome：基于数据特性的标准化和微生物丰度差异分析策略

Rob Knight和团队操刀的方法学文献一篇，特别推荐给大家。

16s rRNA测序标准化归一化丰度差异检验稀释

Science：我们死后，被哪些细菌分解？

今年1月Rob Knight在Science的“恐怖”之作，结果大概是，不管你死后被埋在哪里，分解你尸体的细菌大概都是类似的。。。

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IJLM：分解人尸的细菌，是苍蝇喜欢的？

① 在两具放置在室外的尸体中的不同部位取样本，用454焦磷酸测序分析细菌16S rRNA基因的可变区3-5；② 在降解过程中，每具尸体所有部位的细菌群落结构都发生了变化；③ 在膨胀和排气期，直到组织开始脱水和完全清除，Ignatzschineria和Wohlfahrtimonas这样的与苍蝇有关的细菌很普遍；④ 脱水和骨架化后，与土壤有关的细菌，如不动杆菌属变得普遍。

苍蝇土壤微生物不动杆菌刑事案件法医

神经发育障碍

Cell：菌群及代谢产物调节小鼠的神经发育

【经典文献分享】这是2013年最受关注的肠道菌群研究之一，通过小鼠上的实验，充分证明了肠道菌群和代谢产物深入参与神经系统发育的调控，这对自闭症等神经发育障碍具有重大意义。没有看过的人建议一定好好看看！

神经发育障碍脆弱拟杆菌 Jun Wang Jun Wang Robert Kraaij

尸体分解膨胀期

PLoS One：尸体分解膨胀期起止，细菌群落有何不同？

① 在东南德克萨斯州应用法医学研究所，研究者放置了两具尸体，使其在自然条件下分解；② 分别在包括尸体内部在内的不同身体部位，取分解膨胀期开始和结束两个时间点的样本，对16S rRNA基因进行焦磷酸测序；③ 所有部位样本中，都发现从需氧细菌转变为厌氧细菌的变化，两具尸体间、同一具尸体的不同部位间、同一部位两次取样时间点间的微生物群落组成都不一样；④ 有一些物种与用培养观察到的物种一致，但许多物种是全新的。

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Science：我们死后，被哪些细菌分解？

今年1月Rob Knight在Science的“恐怖”之作，结果大概是，不管你死后被埋在哪里，分解你尸体的细菌大概都是类似的。。。