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18s rRNA基因
文章数:4篇
瘤胃菌群
菌群与宿主互作促进羔羊瘤胃壁的发育
本文使用宏基因组测序和转录组测序的方法,研究了羔羊喂食开食料后瘤胃生理指标、菌群活性和瘤胃上皮细胞的基因表达变化。
瘤胃菌群
crosstalk
Lamb
rumen
Starter feeding
真菌组
Nature综述:关注真菌组多样性
Nature微生物学综述中的一篇文章总结了当前真菌组研究的进展、问题和挑战。作者认为在测序的基础上考虑物种相互作用等方面,将促进对真菌生态系统的认知。
真菌组
高通量测序
18s rRNA基因
宏基因组
宏转录组
扩增子
新引物扩展 18S rRNA 测序检测范围
作者针对单细胞真核生物和寄生虫等设计了新的 18S rRNA 扩增引物,大大提高了对这些物种的检测灵敏度,有助于更全面的认识微生物组。
扩增子
18s rRNA基因
高通量测序
Eukaryotic pathogens
Food and water safety
寄生虫
限制性内切酶助力寄生虫18S rRNA基因测序分析
在利用rRNA基因测序分析宿主体内的寄生虫时,寄生虫与宿主的18S rRNA基因的高度保守限制了该方法的应用。Microbiome上发表的一项最新研究,发现在进行PCR对18S rRNA进行扩增之前,利用限制性内切酶特异性消化宿主序列,可得到更好的测序结果。
寄生虫
Amplicon sequencing
Blood microbiota
Molecular parasitology
Parasite biodiversity