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微生物动力学
文章数:4篇
人体微生物组
刘洋彧Cell子刊:人体微生态操控的展望(综述)
人类体内和体表有大量的微生物,这些微生物及其基因统称为人类微生物组。人类微生物组与人类的健康密切相关。尽管目前我们已经对人体微生物组有了广泛知识。然而,我们对人类微生物组的理解最终需要体现在对其进行操纵以促进健康的能力上。从生物系统学层面上,基于微生物群的疗法仍有许多基本科学和技术的问题需要解决。哈佛大学刘洋彧近期发表在Cell Systems的综述,对领域内的挑战进行了阐述,详细回顾了群落生态学、多层面网络科学和控制理论等各个领域取得的进展,并首先引入了不同的微生物群落模型框架作为微生物群落控制策略的基础,此外专注于简单的种群水平模型(PLMs),讨论了微生物动力学的普适性,介绍了控制微生物群落的理论框架和两种实际控制策略,并提出了一些未来的研究方向。
人体微生物组
微生物组控制
生态网络模型
代谢模型
微生物动力学
预测生物学
Nature Reviews:预测生物学实现建模、理解和驾驭微生物的复杂性(综述)
预测生物学是合成生物学和系统生物学(特别是微生物学)的下一章。曾经似乎不可行的任务正日益得到实现,例如设计和实现执行复杂的传感和驱动功能的复杂的合成基因回路,以及将具有特定,预定组成的多物种细菌群落组装在一起。通过整合生物学,物理学和工程学领域的各种专业知识,使这些成就成为可能,从而使人们对生物学设计有了新的定量认识。随着越来越多的多组学数据集的出现,它们在将理论转化为实践中的潜在效用仍然坚定地植根于控制生物系统的基本定量原理。在这篇综述中,作者讨论了微生物学日益引起人们关注的预测生物学的关键领域,与生俱来的微生物复杂性相关的挑战以及定量方法在使微生物学更具可预测性方面的价值。
预测生物学
定量
建模
深度学习
微生物动力学
大曲
FM:大曲固态发酵过程中接种特定细菌会怎样?
又是关于酿酒的文章,在大曲发酵过程中接种四种不同的细菌,观察因此带来的影响。推荐关注酿酒的群友认真看一看。
大曲
固态发酵
芽孢杆菌
生物强化
微生物动力学
微生物动力学
Nature:人体微生物动力学
人体肠道、口腔、皮肤微生物生长的动力学有什么区别,有什么新方法可用来计算微生物动力学?看看Nature这篇文献。
微生物动力学
Konrad Gronke
Andreas Diefenbach