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DNA-SIP
文章数:2篇
鸟枪法宏基因组学
除了鸟枪法宏基因组测序,我们还能做什么
扩增子测序是使用最广泛但功能有限的入门技术、鸟枪法宏基因组正在逐渐成为本领域的主流方法,但受限技术本身多方面的限制。除了他们还有什么更好的选择吗?本文从三方面对大家将来工作的改进提出展望和指导方向,包括稳定同位素示踪技术(南土所贾仲君组有很多相关文章和提供技术培训),单细胞分选(中科院北京生科院赵方庆团队在Nature子刊发表过相关方法(https://www.mr-gut.cn/papers/read/1087459080)和综述(https://www.mr-gut.cn/papers/read/1034764561)),和三代测序及宏表观组,纽约西奈山医学院有Nature Biotechnology上有2篇相关技术应用成果的报导(https://www.mr-gut.cn/papers/read/1052032728)及Nature综述文章供学习。
鸟枪法宏基因组学
稳定同位素
荧光激活细胞分选技术
三代测序
DNA-SIP
种间互作
海岸带中的细菌和古菌接力将胆碱转化为甲烷
海岸盐沼沉积物中的微生物在厌氧条件下分解季胺和甲基化胺,是甲烷的重要来源。以胆碱为例,它是一个季胺碱,其分解过程分为两步,以三甲胺为中间体。有趣的是,这两个步骤分别由细菌和古菌完成。
种间互作
互养
温室气体
海岸沉积物
DNA-SIP