互养

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文章数：11篇

肠道菌群-致病菌互作

Nature：艰难梭菌感染肠道，肠球菌如何助纣为虐？

致病菌入侵肠道时，面对的不仅是宿主的防御机制，还有复杂的肠内微生物环境。然而，肠道中的其他微生物如何影响病原体的致病力，目前还所知甚少。艰难梭菌是一种危险的肠道致病菌，其感染常伴随条件致病菌肠球菌的扩张，并可与万古霉素耐药的肠球菌发生共感染。Nature最新发表的这项研究揭示了肠球菌作为艰难梭菌感染肠道的“帮凶”的机制。该研究表明，肠球菌的扩张能改变肠腔内的氨基酸组成，从而通过互养和营养限制的平行机制，促进艰难梭菌的定植和致病。总之，肠道菌群的特定代谢特征以及肠腔内的营养环境，能够影响艰难梭菌感染的易感性和严重程度，这为治疗艰难梭菌感染带来新启示。

肠道菌群-致病菌互作肠球菌耐万古霉素肠球菌艰难梭菌肠道致病菌

具核梭杆菌

口腔中的具核梭杆菌如何通过代谢与其它微生物互作？

具核梭杆菌是口腔微生物群的一种常见细菌。之前的研究表明具核梭杆菌和S. gordonii之间存在鸟氨酸互养相互作用，然而，具核梭杆菌在多菌群中更广泛的代谢方面的作用及其对牙周发病机制的影响尚不清楚。mSystems发表的研究表明，其他口腔共生细菌提供的氨基酸可诱导具核梭杆菌产生多胺，从而创造富含多胺的微环境。经由具核梭杆菌代谢整合的营养网络：从精氨酸到鸟氨酸产生腐植酸，加速了牙周病原体牙龈卟啉菌的生物膜生命周期，揭示口腔生物膜内的微生物合作代谢如何促进牙周炎产生。

具核梭杆菌口腔生物膜牙龈卟啉单胞菌精氨酸脱亚胺酶牙周炎

微生物生态学

细菌间的代谢差异，决定了互养关系的建立

不同种类细菌之间的代谢物交换，影响着菌群的结构和功能。什么因素在决定这些互养相互作用的建立？Current Biology发表的这项研究对这一问题进行了探索，表明细菌之间的代谢差异是关键因素。

微生物生态学互养

微生物生态学

Nature子刊：基于生态学的算法，预测人肠道微生物间的互养作用

互养作用是指一种生物利用另一种生物的代谢物来生长/生存的现象。在肠道菌群中，互养作用是不同微生物间建立相互作用的重要机制。Nature Communications近期发表的研究报道了一种能预测人肠道菌群中的微生物互养作用的算法，或能为建立基于宏基因组学和代谢组学的菌群内因果互作关系的模型，提供助力。

微生物生态学微生物互作互养机器学习肠道菌群

Cell子刊：肠道炎症中，多形拟杆菌将其它细菌的铁载体收为己用

炎症期间，我们的身体会限制微生物对铁的利用。Cell Host and Microbe近期发表的一项研究发现，不表达铁载体的肠道共生菌（比如多形拟杆菌）可将其它肠道菌（比如肠杆菌科细菌）生成的铁载体“收为己用”，从而增强自身在宿主肠道炎症环境中的生存能力。这些发现揭示出肠道菌群内部的一种互养机制，可帮助菌群抵抗环境扰动。

肠道炎症菌群内互作 GUT INFLAMMATION iron metabolism siderophore

双歧杆菌共同合作，实现HMO利用最大化

母乳相关的双歧杆菌中富含碳水化合物利用基因和HMO代谢的特定基因簇，这在许多成年个体相关菌株中是不存在的。并且，多种双歧杆菌菌株往往同时存在于同一婴儿肠道，而不是由一株双歧杆菌主导。ISME最近的文章中，为了研究双歧杆菌间的相互作用关系，分析了同一婴儿个体中共存的双歧杆菌菌株的碳水化合利用基因和代谢HMO的基因簇组成，及对HMO的利用能力，并探究了双歧杆菌菌株间的相互作用，从而进一步解释了为什么婴儿肠道中多种双歧杆菌共同存在。本研究结果或有助于开发饮食和微生物疗法，促进生命早期的健康。

母乳寡糖双歧杆菌互养微生物生态学 Kai Zhang

海岸带中的细菌和古菌接力将胆碱转化为甲烷

海岸盐沼沉积物中的微生物在厌氧条件下分解季胺和甲基化胺，是甲烷的重要来源。以胆碱为例，它是一个季胺碱，其分解过程分为两步，以三甲胺为中间体。有趣的是，这两个步骤分别由细菌和古菌完成。

种间互作互养温室气体海岸沉积物 DNA-SIP

Science：菌群组装规律中的简单之美

特定条件下菌群结构的形成有什么规律，是菌群研究的一个主要问题。Science本周发表的最新研究，监测了单一碳源条件下形成的上百个菌群，结合数学建模方法，揭示了复杂群落组装中的简单性，值得菌群研究者特别关注。

群落组装代谢副产物互养 Ryu Okumura Kiyoshi Takeda

抗生素耐受性

细菌互养影响菌群的抗生素耐受性

细菌群落中的互养关系如何影响抗生素耐受性？ISME Journal发表的最新研究，发现互养会降低群落中抗性菌株的耐药性，但同时会提高群落中不耐受细菌的耐受性。

抗生素耐受性互养微生物生态学 Seth M Rudman Seth M Rudman

SR：利用体外发酵模型评估膳食纤维的益生元潜能

Scientific Reports近期发表的一项研究，利用体外发酵模型，评估多种膳食纤维的益生元潜能，分析菌群组成和发酵产物的变化情况。

膳食纤维互养体外发酵模型短链脂肪酸 Ajay Goel

TM：双歧杆菌如何利用多糖和喂养其他细菌？（综述）

这是一篇针对双歧杆菌的重要综述，系统性总结了双歧杆菌如何利用多糖的机制，以及其如何通过代谢多糖为其他细菌提供食物。很精彩的综述，特别推荐。

双歧杆菌多糖利用互养 Bifidobacterium genomics