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荧光激活细胞分选技术
文章数:3篇
不可培养的微生物
死细菌——人类肠道菌群的培养盲区?
尽可能多地分离培养肠道细菌,对于研究肠道微生态以及进行有效干预具有重要意义;但是受限于目前技术条件,人体肠道中存在大量不可培养细菌菌株。Gut Microbes近期发表一项研究,通过联合使用荧光激活细胞分选技术、高通量测序和培养组技术,发现培养技术的局限性并不是部分菌株难以培养的唯一原因,标本的来源很可能对肠道菌株的活性具有重要影响。该研究不仅建立了宏基因组-培养组联用的新型分析方法,也为肠道菌株培养技术提供了理论和技术参考。
不可培养的微生物
培养组学
荧光激活细胞分选技术
鸟枪法宏基因组学
除了鸟枪法宏基因组测序,我们还能做什么
扩增子测序是使用最广泛但功能有限的入门技术、鸟枪法宏基因组正在逐渐成为本领域的主流方法,但受限技术本身多方面的限制。除了他们还有什么更好的选择吗?本文从三方面对大家将来工作的改进提出展望和指导方向,包括稳定同位素示踪技术(南土所贾仲君组有很多相关文章和提供技术培训),单细胞分选(中科院北京生科院赵方庆团队在Nature子刊发表过相关方法(https://www.mr-gut.cn/papers/read/1087459080)和综述(https://www.mr-gut.cn/papers/read/1034764561)),和三代测序及宏表观组,纽约西奈山医学院有Nature Biotechnology上有2篇相关技术应用成果的报导(https://www.mr-gut.cn/papers/read/1052032728)及Nature综述文章供学习。
鸟枪法宏基因组学
稳定同位素
荧光激活细胞分选技术
三代测序
DNA-SIP
菌群研究工具
研究菌群功能活性的新工具
现阶段的菌群研究主要建立在组学数据的分析上,在生理状态下研究特定菌群成员的生化功能,仍有挑战。Journal of the American Chemical Society近期发表一项研究,将活性分子探针与流式细胞技术结合,可鉴定具有特定酶活性的菌群成员。该研究还表明,菌群的代谢功能具有可塑性,在不同宿主个体和扰动情况下,即使菌群组成没有明显差异,发挥特定代谢功能的菌群成员却可能有很大差别。该技术有助于对菌群代谢功能进行深入研究,值得做相关研究的专业人士参考。
菌群研究工具
分子探针
荧光激活细胞分选技术
菌群功能
酶活性