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不可培养的微生物
文章数:6篇
不可培养的微生物
死细菌——人类肠道菌群的培养盲区?
尽可能多地分离培养肠道细菌,对于研究肠道微生态以及进行有效干预具有重要意义;但是受限于目前技术条件,人体肠道中存在大量不可培养细菌菌株。Gut Microbes近期发表一项研究,通过联合使用荧光激活细胞分选技术、高通量测序和培养组技术,发现培养技术的局限性并不是部分菌株难以培养的唯一原因,标本的来源很可能对肠道菌株的活性具有重要影响。该研究不仅建立了宏基因组-培养组联用的新型分析方法,也为肠道菌株培养技术提供了理论和技术参考。
不可培养的微生物
培养组学
荧光激活细胞分选技术
单细胞基因组
单细胞基因组测序解密利用膳食纤维的未培养菌
文章利用单细胞基因组测序技术(SAG-gel)分离并检测了响应膳食纤维干预的菌群,并可据此对其功能进行推断分析。这项技术可以很大程度地解密未培养菌的功能特点,助力膳食-菌群-代谢性疾病研究。
单细胞基因组
饮食-菌群互作
菊粉
肠道菌群
不可培养的微生物
合成生物学
合成生物学方法研究不可培养细菌的两个实例
Nature Microbiology的一篇观点文章中,提及了两项通过合成生物学方法研究菌群中不可培养细菌的实例。
合成生物学
不可培养的微生物
基因水平转移
CRISPR基因编辑系统
固氮酶
海洋菌群
山东大学:低养分富集培养有助于不可培养细菌的复苏和分离
山东大学杜宗军教授团队通过特殊培养基分离鉴定海洋沉积物中的不可培养微生物,获得巨大成功。
海洋菌群
深海沉积物
Enrichment culture
metatranscriptomics
Mixed culture
不可培养的微生物
估量不可培养微生物的庞大数量
mSystems上的一篇评论文章,对“Phylogenetically Novel Uncultured Microbial Cells Dominate Earth Microbiomes”一文发表了看法,提出了一些原文在分析中存在的问题,包括取样偏差、数据分析方法不完全合适等。
不可培养的微生物
地球微生物组
Amplicon sequencing
metagenomics
metatranscriptomics
地球微生物组
由不可培养微生物“主宰”的地球环境
mSystems上发表的一项最新研究,通过对不同环境下的宏基因组和宏转录组中的16S rRNA基因序列进行分析,发现不可培养的(Uncultured)微生物在地球上所有的微生物中占了极高比例,且在各类非人类的环境中发挥了重要的作用。
地球微生物组
不可培养的微生物
地球微生物组
环境微生物
uncultured microbes