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群落演替
文章数:4篇
整合分析
ISME:整合分析揭示塑料圈微生物组的全球多样性
本研究首次对利用16S rRNA基因扩增子测序的所有塑料圈研究进行了全面的再分析。通过机器学习方法,作者发现环境因素(例如环境和光的可用性)以及研究设计的各个方面(例如引物对和孵育时间)在影响塑料圈群落组成方面起着重要作用。更为重要的是,与对照生物膜相比,不同塑料材质类型和群落演替的不同阶段都可以对其进行区分。作者确定了在塑料上形成的生物膜中比对照生物膜中更丰富的微生物群落成员。这突出表明,迫切需要确定这些微生物是否具有塑料生物降解能力,或者是人类或其他生物体的病原体。作者还确定了一些他们甚至缺乏基础知识和未来研究方向的其他关键领域。显然,塑料污染是人类世界的关键指标,如果希望减轻其影响,则必须将未来的研究重点放在作者在此强调的知识空白上。
整合分析
塑料圈
定殖
塑料生物降解能力
群落演替
合成菌群
互适应性、确定性和随机性在人类肠道菌群组装中均发挥重要作用
互适应性(coadaptation)指的是菌群中的不同物种长期共存后建立的相互作用关系的作用;确定性(determinism)和随机性(stochasticity)则是另外两个关键的群落组装模式。在养分、适应性变化的时候,虽然侧重点不同,但是三种机制在人肠道菌群的组装中都有重要作用。
合成菌群
群落组装
合成群落
饮食调控
生物反应器
抗性组
替加环素作用下生物膜反应器中的抗性组变化
在一个周期为636天的实验中,来自于中科院生态环境中心的研究人员通过在合成污水中加入 0-25 mg/L 的替加环素,探索抗生素持续暴露对水处理系统中好氧生物膜群落的结构和抗性组的影响。
抗性组
Dynamics
Resistome
Biofilm microbiota
Tigecycline
环境菌群
国际空间站中的环境菌群及耐药基因
《Microbiome》上发表的一项研究,对国际空间站中的环境菌群进行了宏基因组分析,可检测到多种致病菌、耐药基因及毒力因子。该结果有助于阐释环境菌群的形成的发展,有助于优化空间站等密闭空间环境的方法。
环境菌群
built environment
functional metagenomics
International Space Station
metagenome