Flux balance analysis

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Flux balance analysis

文章数：3篇

个性化全身模型

新型个性化全身模型可预测疾病标记物和基础代谢速率

精准医疗的一个重要目的是通过建立可预测的个性化人体计算模型，预测可能的治疗方案。本文作者建立的分为男女两种的人体计算模型，同时考虑了传统的生理指标和组学数据，具有器官特异性，在分子水平上和基因组范围内再现了人体全身代谢模型。该模型的介绍和使用方法在https://opencobra.github.io/cobratoolbox/stable/index.html，欢迎读者尝试。

个性化全身模型 Flux balance analysis human metabolism metabolic modeling Microbiome

Cell子刊：共生菌中铁与活性氧的平衡，促进线虫正常发育

铁是生物所必需的微量营养素，铁缺乏和过量都对健康有害。Cell Host and Microbe发表的一项研究发现，大肠杆菌中因活性氧升高或铁转运基因突变引起的铁水平降低，可导致喂饲的线虫发育迟缓。

铁 C. elegans E. coli Diet Metabolism

【技术】脂肪组织代谢模型帮助预测2型糖尿病作用靶点

① 这篇文章用系统生物学方法构建虚拟1个新的脂肪细胞代谢网络；包含1390个基因，4519个位点和3664个代谢物。② 通过与不同细胞系实验中的基因重要性、生物质的产生进行对比，证明该模型的准确率达92%。③ 通过各种条件下的流平衡分析，该模型指出：脂滴和生物质生产基因的去除，帮助识别了缓解脂肪组织肥大的27个基因。④ 文章也比较了单个基因清除对肝脏和外周脂肪的影响。⑤ 总体来看，该代谢模型较为精确，可以用于预测2型糖尿病作用靶点。

脂肪细胞代谢网络 2型糖尿病系统生物学 Adipocytes