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文章数：10篇

吲哚类物质

Cell子刊：细菌产生的“吲哚因子”，介导跨界防御应答

人体肠道细菌可产生的上万种小分子物质，虽然某些物质可影响肠道菌群组成和功能并调节宿主免疫，但大多数都是功能未知的。发表在《Cell Chemical Biology》上的文章对特定吲哚类物质（indolokine，“吲哚因子”）的功能进行了深入研究，发现该类物质广泛存在于不同细菌和小鼠粪便中，并可促进细菌耐药细胞形成、激活植物防御反应及人免疫反应。该研究将细胞应激诱导的代谢产物与细菌、植物和人类的防御反应联系起来，表明生物界存在着相对保守的防御策略。

吲哚类物质 stress response indole SIGNALING E. coli

将大肠杆菌改造为天然产物的合成工厂（综述）

工程菌可用于天然产物的大规模生产，《Trends in Biotechnology》发表的这篇综述文章详细介绍了改造大肠杆菌以产生特点天然产物的代谢工程策略、代表性例子以及前景和挑战。

工程菌天然产物 E. coli systems metabolic engineering natural products

Cell子刊：共生菌中铁与活性氧的平衡，促进线虫正常发育

铁是生物所必需的微量营养素，铁缺乏和过量都对健康有害。Cell Host and Microbe发表的一项研究发现，大肠杆菌中因活性氧升高或铁转运基因突变引起的铁水平降低，可导致喂饲的线虫发育迟缓。

铁 C. elegans E. coli Diet Metabolism

热导法检测

灵敏快速检测样本中大肠杆菌的方法

生物感应器在食品安全、质量评价以及环境检测中的应用越来广泛。由于在生物在分子结合、受体识别、相态转变等多种过程中均会产生热的变化，因此基于热传导的生物感应受到了广泛的关注。大肠杆菌含量是是环境、食物等经粪便污染的重要指标，对食品安全、饮用水安全以及抗生素水平的评价具有重要作用。因此，如何实现对自然样本中大肠杆菌的特异地、灵敏地、快速地检测一直以来都是人们亟需解决的问题。目前常用的方法有PCR检测、菌落培养法检测以及免疫检测，但这些方法或者灵敏度高，但耗时较长，或者快速，但灵敏度低。近来有研究开发出基于热传导的检测方法，虽然快速但灵敏度不够。近期一篇发表在Biosensors and Bioelectronics上工作，对基于热传导检测大肠杆菌的方法进行了优化和改进，通过受体在不锈钢材料的固定化和热阻感应器的优化，使得基于热传导检测大肠杆菌的灵敏度大大提升至10^2CFU/mL的水平。

热导法检测灵敏度特异性 Biomimetic sensors E. coli

Cell子刊：吃进去的益生菌也会变异

《Cell Host and Microbe》近期发表研究，发现潜在益生菌大肠杆菌Nissle株在营养成分、抗生素药物的筛选压力之下会发生演化，获得之前不具有的糖苷水解能力、肠粘液分解能力和抗生素耐药性，可能影响益生菌运用的安全性。本研究所用的方法可用来评估潜在益生菌的安全性和基因操作潜力，对于开发益生菌产品具有重要参考价值。

益生菌 Probiotic E. coli Microbiome evolution

肠道致病菌

为了生存，肠道致病菌如何调控基因表达（综述）

肠道病原菌是导致大多数食源性疾病的原因。这些细菌进入体内后，通过“优雅的”基因表达调控机制逃避宿主免疫系统的监管，最终成功在肠道微环境中建立生态位。《Frontiers in Microbiology》近期发表综述，总结了多个病原菌共有和特有基因表达调控通路，及其在病原菌生存中发挥的重要作用。

肠道致病菌 E. coli salmonella Shigella enteropathogen

宿主-菌群互作

Cell：宿主利用共生菌产物，维持自身铁稳态

宿主-菌群互作中，菌群衍生物有关键作用。Cell本周上线一项华人学者的研究，以线虫为模型，通过细菌基因突变筛选，发现共生大肠杆菌产生的铁载体——肠杆菌素，可以与宿主线粒体中的ATP合成酶α亚基互作，在宿主的铁摄入和稳态维持中有关键作用。这些发现加深了对宿主-菌群互作的认识，其研究方法对于分析特定菌群产物对宿主影响的机制，很有参考价值。

宿主-菌群互作 ATP-1 ATP5A1 ATP-2 labile iron pool

BMC G：克罗恩病患者体内大肠杆菌的基因组分析

这是一项针对克罗恩病患者体内大肠杆菌的全基因组序列分析，值得认真看看，特别推荐。

克罗恩病大肠杆菌 E. coli Genome Propanediol

Microbiome：不使用抗生素，牛奶菌群也可在感染后自行恢复

奶牛的乳腺炎，是农业养殖中备受关注的疾病，目前在美国常规的方法是使用抗生素头孢噻呋。这项研究发现感染大肠杆菌后的牛奶菌群显著改变，但不管是否使用抗生素，最后都会恢复。很值得关注，特别推荐！

牛奶菌群乳腺炎头孢噻呋大肠杆菌 Milk microbiome

CMI：医用大麻里有什么微生物？

医用大麻里能鉴定出4000种真菌分类，这些可能在给病人使用的时候产生风险，有意义的研究，推荐。

Acinetobacter Aspergillus E. coli Klebsiella Mucorales