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天然产物
文章数:18篇
蜜蜂肠道菌群
郑浩团队Nature子刊:挖掘蜜蜂肠道菌群,发现新的抗致病菌天然产物
社会性传粉昆虫式全球农业的重要组成部分,比如蜜蜂和大黄蜂。蜜蜂和大黄蜂与一个简单但是受到宿主限制的肠道群落有关,这个群落可保护宿主免受病原体感染。中国农业大学的郑浩团队在Nature Communications发表文章,通过研究蜜蜂肠道微生物群中生物合成基因簇(BGC)的多样性,发现蜜蜂肠道菌群中广泛存在小分子编码BGC,并鉴定出具有抗菌潜力的新型核糖体肽,揭示出细菌衍生的天然产物可作为潜在的抗菌剂来对抗致病性感染。
蜜蜂肠道菌群
生物合成基因簇
天然产物
抗菌肽
药物研发
上海交大:独特微生物资源生物合成潜能释放新方法(综述)
微生物天然产物是小分子药物开发的主要来源。然而,传统天然产物发现局限于常规药源微生物资源,同时活性筛选方法盲目性大重现率高,导致新结构、新靶点天然产物匮乏,严重制约了新药研发。近日,上海交通大学李雷及团队在Biotechnology Advances发表最新综述,针对不同生境的未充分挖掘的独特微生物资源,梳理了三类天然产物高通量发现的前沿技术及应用案例,为微生物新药开发提供了崭新思路,值得关注。
药物研发
天然产物
综述
微生物合成
高通量测序
COVID‐19
iMeta:国内团队开发抗新冠传统中医药及其机制与疗效的数据库
本研究系统收集了抗COVID-19中医药方、草药、天然产物数据,开发了TCM2COVID数据库,为收录、查询和浏览抗 COVID-19中医药治疗方案提供了一个友好且实用的平台,并将有助于阐明新的抗COVID-19中医药疗法的作用机制,助力抗击新冠疫情。TCM2COVID网址:http://zhangy-lab.cn/tcm2covid/。
COVID‐19
数据库
草药
天然产物
中药
药物递送
华中科大:酵母微胶囊递送的抗炎天然产物可有效治疗小鼠结肠炎
华中科技大学同济药学院的张志平团队与孔丽团队在在ACS Applied Materials & Interfaces上发表的一项最新研究结果,利用酵母微胶囊递送两种具有抗氧化及抗炎活性的天然产物,可通过调节巨噬细胞的极化,从而治疗DSS诱导的小鼠结肠炎。
药物递送
溃疡性结肠炎
研究论文
基础研究
啮齿动物(小鼠)
合成生物学
Cell:合成生物学方法新突破,助力挖掘微生物组代谢物
微生物生成的天然产物是一座仍待挖掘的巨大宝库,这些天然产物的生成依赖于微生物编码的生物合成基因簇(BGC)。然而,目前对BGC的研究仍然存在多方面的技术难题,阻碍了对微生物天然产物的挖掘。Cell最新发表的论文报道了一种新方法,可以设计能在多样化的细菌和真核微生物中实现跨界表达的遗传元件,可用于发现和表征微生物组中的天然产物及其生物合成通路。
合成生物学
天然产物
生物合成基因簇
肠道真菌
厌氧肠道真菌——待挖掘的天然产物藏宝库
厌氧真菌(Neocallimastigomycetes纲)是食草动物消化道中丰度较低的成员。来自PNAS上发表的一项最新研究,对4种厌氧肠道真菌物种进行多组学分析,鉴定出了多种编码生物合成酶的基因,并确定了其中具有转录活性的基因,同时验证了酶产物的存在。该研究结果揭示,厌氧肠道真菌中可能含有多种生物活性化合物。
肠道真菌
研究论文
基础研究
天然产物
结直肠癌
南方医院:可抑制结直肠癌的天然产物
南方医科大学的齐鲁、丁彦青与团队在Free Radical Biology and Medicine上发表的一项最新研究,筛选出一种可在体外及体内有效抑制结直肠癌生长的小分子天然产物——大果桉醛I(Macrocarpal I),后者主要来自于植物体内,可通过破坏细胞骨架、促进细胞凋亡、降低激酶活性、抑制DNA错配修复相关基因的表达等方式起到抑制结直肠癌细胞增殖的作用。
结直肠癌
大果桉醛I
研究论文
基础研究
啮齿动物(小鼠)
工程菌
将大肠杆菌改造为天然产物的合成工厂(综述)
工程菌可用于天然产物的大规模生产,《Trends in Biotechnology》发表的这篇综述文章详细介绍了改造大肠杆菌以产生特点天然产物的代谢工程策略、代表性例子以及前景和挑战。
工程菌
天然产物
E. coli
systems metabolic engineering
natural products
化疗粘膜炎
农科院团队:藻酸盐寡糖或能预防化疗引起的小肠粘膜炎
世界范围内,癌症发病率持续上升,胃肠道粘膜炎是化疗患者常见的副作用。用于治疗慢性髓系白血病的抗癌药物白消安容易引起患者(特别是儿童患者)胃肠道粘膜炎。来自中国农业科学院的张宏福研究团队在Mucosal Immunology发表最新研究,旨在探索藻酸盐寡糖(AOS,一种具有药用潜力的天然产物)在单细胞水平预防白消安引起的小肠粘膜炎。该研究发现AOS可改善肠道细胞群和细胞功能,并揭示了其潜在机制。该研究认为,作为一种天然产物,AOS具有许多优点,可用来帮助正在接受抗癌化疗或其他治疗的患者恢复肠道功能。
化疗粘膜炎
天然产物
藻酸盐寡糖
单细胞RNA测序
甘露糖受体
天然产物
Cell子刊:挖掘菌群天然产物的新工具
核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPP)是一类天然产物,微生物是其重要来源,在医药和食品工业上有广泛应用前景;但目前对这类物质的发掘存在局限性。Cell Systems报道的一种软件工具——MetaMiner,可通过分析同一微生物群落的宏基因组和质谱数据,来挖掘其中的已知和未知RiPP。
天然产物
ribosomally synthesized and post-translationally modified peptides
computational mass spectrometry
metagenomics
natural products discovery
生物信息
生物信息天然产物合成有活性的环状肽
测序细菌基因组的生物信息学分析发现了越来越多的天然产物生物合成基因簇(BGC),这类工具常用的有antiSMASH系列。本文在这些基因簇基础上,进一步设计改造新的天然产物合成通路,并生成了一种有活性的环状肽,为生物信息学设计天然产物合成提供了一种可参考的方法。
生物信息
天然产物
生物合成基因簇
Saman Soleimanpour
Shokufeh Ghasemian Sorboni
天然产物
海藻天然产物或能缓解炎症、调节菌群
海藻具有化学预防和抗炎特性,但对其生物活性成分所知有限。Free Radical Biology and Medicine近期发表一项研究,揭示了海藻的非极性提取物及其中的活性成分cymopols,在细胞和动物模型中能发挥抗氧化、抗炎和调节菌群的作用和相关分子机制。
天然产物
seaweed
natural products
Cancer Prevention
Nrf2
肠道菌群代谢产物
张友明+尹佳:挖掘肠道菌群天然产物的“宝藏”(综述)
肠道菌群有巨大的生物合成潜力,生成的天然产物在医药、农业和食品加工业有广泛的应用前景。Cell旗下刊物Trends in Biotechnology近期发表了由山东大学张友明和湖南师范大学尹佳等共同撰写的综述,详细介绍了哺乳动物肠道菌群次生代谢产物的结构和功能的多样性,探讨了挖掘这些“宝藏”的策略和方法,非常值得专业人士关注。
肠道菌群代谢产物
肠道菌群
天然产物
生物合成基因簇
培养组学
天然产物
综述:生物合成真菌天然产物的研究进展
真菌天然产物在制药和保健品行业具有重要应用价值。Trends in Biotechnology上的一篇综述总结了当前研究中的进展,值得专业人士参考。
天然产物
真菌
biomolecular engineering
Biotechnology
combinatorial biosynthesis
抗癌药物
寻找抗癌物,别忽略了共生菌这座宝库
植物天然产物要抗癌药物的重要来源。但是越来越多证据表明,源于植物/海洋生物的抗癌物质,其直接生产者是共生微生物,而且物质生产过程涉及复杂的宿主-菌群互作。本文回顾了大量相关领域研究,对于抗癌药物的开发、生产具有参考价值。
抗癌药物
宿主-微生物互作
天然产物
天然产物
Nature子刊:在拟南芥叶际菌群中寻找新型抗生素
Nature Microbiology上发表的一项最新研究,对拟南芥叶际菌群中分离出的菌株之间的互作进行了分析,鉴定出了抑菌效应最强的菌株,并从中分离出了一种新型抗生素。
天然产物
抗生素
拟南芥
叶际菌群
Michael G Constantinides
海洋动物-细菌共生
NPR:如何研究海洋动物-细菌共生中的天然化合物
共生细菌与其宿主通过天然产物(如小分子化合物)产生相互作用,如何确定这些物质的来源和产生途径是一大难题。Natural Product Reports发表的一篇长综述,总结了在海洋动物-细菌共生体中确认关键化合物来源的实验方法,及常用行业术语,值得专业人士参考。
海洋动物-细菌共生
分离培养
互惠共生
天然产物
Frederik Schulz
天然产物
Nature子刊:如何解锁海洋菌群中潜在的小分子药物
这是Nature Chemical Biology[IF:15.066]针对同期重要研究(http://www.xunludkp.com/papers/read/1046040332)的新闻报道,老规矩,这样的文章看看图就会有收获。
天然产物
新药研发
海洋菌群
Irva Hertz-Picciotto
Irva Hertz-Picciotto