分离培养

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分离培养

文章数：8篇

16S 扩增子测序

iMeta：中国农大揭示有机农业长期定位试验番茄菌群结构

在长期定位试验条件下环境因素对番茄菌群结构的影响尚不明晰。本研究在长期定位试验的基础上，通过16S 扩增子测序和分离培养技术比较了不同种植模式下番茄内生细菌的群落结构。本文综合分析了器官生态位和种植模式对番茄内生菌群的相对贡献。本研究将有助于全面了解温室农业生态系统中番茄内生菌群结构，并为有益菌群服务于农业生产提供指导意义。

16S 扩增子测序分离培养种植模式番茄内生细菌器官生态位

宏基因组数据

农科院团队：用宏基因组指导未培养微生物的分离培养（综述）

宏基因组数据日益丰富，为指导靶标微生物的分离和培养带来了新的机遇。中国农科院王加启、赵圣国与团队近期在Microbiome发表文章，对利用宏基因组数据指导的微生物分离培养方法的研究进展进行了综述，介绍了基于宏基因组数据分离和靶向微生物培养的新方法及应用，主要包括特定培养条件的设计、特异性抗体捕获分离、靶向基因筛选分离等技术。通过未培养微生物基因组信息预测其代谢特征和生长需求，为分离培养新的微生物并解析其功能特征提供了突破机遇。

宏基因组数据分离培养靶向基因筛选未培养微生物稳定性同位素探针标记

卷曲乳酸杆菌

揭秘阴道中卷曲乳杆菌基因组

女性阴道菌群根据其优势菌是否为乳酸菌可分为乳酸菌主导（LVM）和非乳酸菌主导（DVM）；而目前研究基本认为，阴道中卷曲乳杆菌是“有益菌”，其主导的阴道菌型是对人体有益的。本研究创新性地关注LVM和DVM中卷曲乳杆菌的表型及基因型差异，发现了其中基因型在糖原降解方面基因的差异。为进一步揭示乳酸杆菌与人体阴道表皮细胞的作用提供思路。

卷曲乳酸杆菌分离培养全基因组测序微生物表型组阴道菌群

山东大学：低养分富集培养有助于不可培养细菌的复苏和分离

山东大学杜宗军教授团队通过特殊培养基分离鉴定海洋沉积物中的不可培养微生物，获得巨大成功。

海洋菌群深海沉积物 Enrichment culture metatranscriptomics Mixed culture

Cell：细菌“好朋友”帮助植物抵御真菌危害

细菌，真菌和卵菌分别产生于约 35，10 和 5 亿年前，并且在陆生植物出现 (约4.5亿年前) 之前就在土壤中共存和相互作用。Cell 上的一项研究中综合使用菌群网络分析（含3个地区中的土壤微生物群落）、菌群构建（含148种细菌、34种真菌和8种卵菌）和体外大规模互作实验（2862对互作）确定，根际细菌才是拟南芥的“好朋友”，帮助拟南芥应对真菌的危害。

种间互作根际菌群 bacteria Fungi microbe-microbe interactions

再这么配培养基，你的细菌都被毒死了！

作者基于先前的研究结果即PS培养基可改善某些生长缓慢和/或生长不良微生物的菌落形成，并希望结合简单的长期培养方法从自然环境中分离生长缓慢的新的微生物，作者经过实验得出，通过使用将长期培养与简单修饰琼脂培养基制备相结合的分离策略，可以改善以前未培养的具有系统发育新奇细菌的可培养性。作者希望未来将此策略应用于各种环境样品，特别是在贫营养的自然环境（例如淡水和海水）中，将能够分离出许多系统发育和功能新颖的微生物。

分离培养琼脂平板 Zoé Pochon Nora Bergfeldt Anders Götherström

Nature子刊：菌株培养测序分析女性膀胱菌群

宏基因组学分析表明，女性膀胱中存在固有菌群，然而由于缺乏菌株层面的基因组测序信息，难以进行菌株追踪和功能分析。Nature Communications[IF：12.124]本周发表的最新研究，分离、培养并测序了女性膀胱菌群中约2/3的菌株，并与阴道和肠道菌群进行对比，揭示出阴道与膀胱菌群的相似性，为开展菌群/特定致病菌或共生菌的功能性研究打下基础。

膀胱菌群泌尿生殖器分离培养宏基因组 Bacterial genetics

海洋动物-细菌共生

NPR：如何研究海洋动物-细菌共生中的天然化合物

共生细菌与其宿主通过天然产物（如小分子化合物）产生相互作用，如何确定这些物质的来源和产生途径是一大难题。Natural Product Reports发表的一篇长综述，总结了在海洋动物-细菌共生体中确认关键化合物来源的实验方法，及常用行业术语，值得专业人士参考。

海洋动物-细菌共生分离培养互惠共生天然产物 Frederik Schulz