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遗传背景
文章数:4篇
可移动抗性基因组
Microbiome:港大张彤组纳米孔测序解析污水处理中可移动抗性基因组
为了能够全面了解污水处理体系中抗生素抗性基因以及多抗耐药菌株的动态传播过程,我们需要解析不同抗生素抗性基因的遗传背景、宿主信息并且追踪它们在整个污水处理体系过程中的变化。然而不管是基于传统的耐药菌株分离培养的方法,还是基于二代测序组装、或者epicPCR的方法都不能达到理想的解析效果。随着三代测序技术的发展,长读长的特点为我们解析复杂的遗传元件提供了可能性。该研究充分利用了Nanopore测序长读长以及实时测序的优势,开发了一套基于高通量测序的抗性基因遗传背景解析、宿主鉴定的分析流程。该论文所构建的分析流程不仅使我们对污水处理体系可移动抗性基因组有了全新的认识,同时为进一步解析耐药菌株的产生以及传播机制提供了重要参考。
可移动抗性基因组
纳米孔测序
接合质粒
遗传背景
宿主追踪
脊柱关节炎
AR:疾病易感性或与遗传背景对肠道菌群的影响有关
这是Arthritis and Rheumatology[IF:6.918]发表的重要的宿主基因如何影响肠道菌群、炎症状态和疾病易感性的研究,发现将HLA-B27基因转入大鼠后,不同遗传背景的大鼠的情况有所不同。这值得关注免疫机制研究的专业人士认真阅读。特别推荐。
脊柱关节炎
遗传背景
免疫失调
细胞因子
质谱
FM:母乳中的IgA对幼鼠对抗致病菌至关重要
通过质谱、液相色谱、MSMS shotgun宏蛋白组分析等方法监测新生小鼠的肠道菌群变化,发现母乳中IgA的核心重要性,很值得一看的paper。
质谱
围产期
肠道菌群
遗传背景
母乳喂养
饮食限制
ARR:限制不同遗传背景老鼠的饮食,增寿效果大不同(综述)
这是AGEING RESEARCH REVIEWS[IF:7.452]在2012年发表的关于大鼠和小鼠的饮食限制所带来的延长寿命效果的系统性综述,发现不同遗传背景对此的决定作用巨大。特别推荐!
饮食限制
小鼠
大鼠
遗传背景
Alberto Papi