次级代谢产物

搜索
登录

次级代谢产物

文章数：7篇

国内团队：发酵食品是生物合成基因簇和次级代谢产物的储存库

微生物的生物合成基因簇（BGC）能够编码具有生物活性的次级代谢产物，它可以在微生物-微生物和宿主-微生物相互作用中发挥重要作用。发酵食品被认为对人体健康有益，然而全球食品发酵中次级代谢物的生物合成潜力的多样性和分布在很大程度上仍然未知。江南大学吴群教授团队在Microbiome发表最近文章，通过宏基因组学分析对全球发酵食品中的BGC进行了大规模和全面的调查，研究表明发酵食品是尚未开发的BGC和具有生物活性的次级代谢产物的储存库，这项研究将有助于阐明发酵食品对健康有益的潜力，并提示从发酵食品中开发新型生物活性化合物的发展前景。

发酵食品生物合成基因簇研究论文基础研究次级代谢产物

次级代谢产物

微生物组成或可调节细菌群落的次级代谢？

细菌次级代谢产物是抗生素和其他生物活性化合物的主要来源，在微生物群落中，这些分子可以介导物种间的互作，进而适应环境变化。尽管次级代谢物在人类健康和微生物生态中具有重要作用，但对其在多物种群落中的作用和调节仍知之甚少。近日，华盛顿大学研究人员在PNAS发表最新研究，设计了包含蜡样芽孢杆菌、约氏黄杆菌和韩国假单胞菌组成的简易群落模型，发现次级代谢物动态变化和群落物种组成和种间互作有关，改变其中物种数量会影响整个群落的生物合成基因簇表达和代谢谱。总之，该研究提供了一种分析微生物群落的信息交流方法，有助于未来精准操控微生物群落功能。

次级代谢产物菌群组成研究论文基础研究微生物生态学

次级代谢产物

Nature子刊：大规模分析细菌编码的次级代谢产物

Nature Microbiology发表的这项研究，采用两种算法对细菌基因组数据进行了大规模挖掘，全面分析了细菌中编码的次级代谢产物，揭示了各菌属之间生物合成多样性的巨大差异，并鉴定出多个有研究前景的细菌分类群。该研究的发现和提出的分析方法流程，对于从细菌中挖掘候选药物具有参考意义。

次级代谢产物细菌基因组学宏基因组学

国内团队：放线菌生命暗物质的生态功能与进化的新进展

中山大学生命科学学院李文均教授课题组研究表明滇藏热泉生态系统中蕴含着丰富的放线菌生命暗物质资源。该研究首次提出放线菌三个新纲类群可能具有同型产乙酸功能，刷新了放线菌功能多样性的认知；作者通过进化分析，在展现放线菌氢依赖的WLP进化历史的同时，揭示了放线菌在WLP进化历史的重要性。该研究对放线菌生命暗物质的研究打开了另一个充满惊喜的“魔术盒”，让我们了解到放线菌的奇妙之处不只在次级代谢产物多样性上，其在生态功能和WLP进化历史中也起着重要作用。对于科研工作者而言，此工作仅是进一步探索放线菌生命暗物质生态功能和进化机制的开始。

放线菌宏基因组组装基因组(MAGs) 功能多样性 Wood–Ljungdahl pathway (WLP) 次级代谢产物

宏基因组组装基因组(MAGs)

Nature子刊：地球微生物组的基因组目录

鸟枪基因组的细菌和古细菌基因组的重建使人们对生态学以及与环境和宿主相关的微生物群落的进化有了深入的了解。本文中，作者将这种方法应用于从覆盖整个地球各大洲和海洋的不同栖息地收集的10,000多个宏基因组。该综合目录包括52,515个由宏基因组组装的基因组，它们代表跨越135个门的12,556个新的候选物种水平的操作分类单位。该目录将已知细菌和古细菌的系统发育多样性扩展了44％，可广泛用于简化的比较分析，交互式探索，代谢建模和批量下载。作者演示了这一集合的效用，用于了解次级代谢物的生物合成潜力和解决成千上万的新宿主与未被培养的病毒的联系。该资源强调了以基因组为中心的方法在揭示影响生态系统过程的未培养微生物的基因组特性方面的价值。

宏基因组组装基因组(MAGs) 地球微生物组（GEM）系统发育多样性宏基因组分箱次级代谢产物

antiSMASH数据库

antiSMASH数据库2—次级代谢物基因簇预测

源于微生物的天然产品经常用于抗菌和抗癌药物、杀虫剂、除草剂或杀菌剂。近二十年来，基因组数据的不断增加，使通过基因组挖掘来获取化合物的生物合成簇成为可能。antiSMASH是该领域最流行的工具之一。自2011年首次发布以来，antiSMASH已成为次级代谢产物基因组挖掘的标准工具，antiSMASH数据库为许多公开可用的微生物基因组提供预先计算的antiSMASH结果，并允许进行高级跨基因组搜索。目前是该任务最广泛使用的软件流程，引用超3000次。

antiSMASH数据库次级代谢产物预测注释基因簇

功能食品和保健营养品

【营养前沿】组学技术，让植物更营养？

① 代谢组学与最终的生物表型相关，因而可以进行高通量的化学成分分析。② 本文介绍FFNs类植物活性代谢产物，其代谢途径及其营养健康作用。③ 本文介绍不同代谢产物分析平台及实验要点；代谢组学结合生物技术在FFNs开发中的应用；代谢组学对作物育种的意义。④ 本文新视角：将生物技术、代谢组学和其他组学联合应用，通过基因编辑技术设计次级代谢途径，以提高植物活性代谢产物的含量，有助于FFNs的开发。

Functional foods and nutraceuticals metabolic engineering metabolic pathway regulation metabolomics metabolomics assisted breeding