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DNA提取
文章数:5篇
人类菌群
人类肠道菌群宏基因组测序中DNA提取和文库构建方法的验证和标准化
高通量测序菌群测量方法的验证和标准化是支持人类菌群研究及其工业化的必要条件。该研究旨在建立基于标准的解决方案,以提高基于宏基因组学的人类粪便样本菌群分析的准确性和可重复性。本研究中提供的经验证的DNA提取和文库构建方案和方法学指导,拓展了目前人类粪便菌群宏基因组分析的最佳实践。采纳本研究的实验方法和指南将提高基于宏基因组学的人类菌群研究的准确性和可比性,从而促进基于人类菌群产品的开发和商业化。
人类菌群
宏基因组
肠道菌群
标准化
准确性
DNA提取
FEMS ME:不同DNA提取方法,得到的菌群信息不一样
方法学必读文献,不要问小秘书为什么,看标题自然就应该必读的。
DNA提取
多样性
Frank R M Stassen
Paul H M Savelkoul
DNA提取
SR:提取宏基因组DNA的靠谱改进方法!
这篇文章的作者自诩新方法能成为DNA样本提取的黄金标准,每天都在提取DNA的群友们看一看评一评,告诉大家真的有那么牛气冲天么?
DNA提取
THSTI
宏基因组测序
方法学
Janelle S Ayres
多糖
多糖对肠道宏基因组研究中的DNA提取产生影响
① 粪便中存在的细菌产生的胞外多糖会对DNA提取及宏基因组研究产生影响; ② 本文研究对比通过10种不同DNA提取方法得到的肠道菌群组成的结果; ③ DNA提取方法影响门水平的相对丰度; ④ 提取DNA时是否降解多糖会显著影响最后的测序结果,建议在机械裂解粪便的同时降解多糖。
多糖
DNA提取
宏基因组
空气微生物
Nature方法学:怎样研究空气微生物?
① 本文介绍了一种新的空气微生物DNA提取及宏基因组测序方法,显著提高DNA提取效率和增加DNA提取的量,可直接用于宏基因组文库构建和测序;② 以北京某地收集的空气悬浮颗粒为例,此方法可从空气中悬浮颗粒(PM)里提取出约5~50纳克数量级的微生物DNA;③ 整个方案需要2-3天,约12h的时间即可完成,所需设备为分子生物实验室常规设备;④ 此方法也可应用于其他生物量不足环境样本的微生物DNA提取和宏基因组测序。
空气微生物
DNA提取
宏基因组测序
Tom J Battin
Tom J Battin