数据分析方法

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文章数：4篇

数据分析方法

Nature子刊：采用合成菌群优化菌群分析手段

菌群的复杂性和检测手段的差异限制了不同样本间菌群的可比性。本研究开发了可用于菌群分析的内参基因组，并且通过模拟菌群、真实菌群证实了这一内参的的有效性，指出这一人工内参在提高样品间可比性、剔除实验操作干扰等方面的优势，对多样本菌群分析具有显著参考价值，值得专业人士关注。

数据分析方法人工内参序列 Tom Van de Wiele Kim De Paepe

菌群生态学

Nature子刊：研究菌群功能的新方法

在自然条件下定量分析复杂菌群中不同细菌种系的生态功能是研究的难点。本研究采集了753个天然淡水微生物群落，在同一条件下培养，通过分析物种丰度和生态功能之间的相关性、不同细菌种系互作对特定生态功能的影响，发现菌群功能与菌群种系丰度存在复杂的关联性，且一定程度上推翻了菌群功能冗余这一假说，对于研究菌群互作、菌群功能等具有参考价值，值得专业人士参考。

菌群生态学菌群功能分析菌群培养数据分析方法 C Cutler

数据分析方法

难以校准的16S rRNA基因拷贝数

作者对比三款新数据分析工具对16S rRNA基因拷贝数的预测能力，发现目前的分析技术仍然具有局限性，难以通过菌群分析来准确预测大部分菌群的16S rRNA基因拷贝数，并以此提出建议，不推荐在常规菌群分析中进行16S rRNA基因拷贝数预测，值得专业人士参考。

数据分析方法 16S rRNA基因拷贝数 16S rRNA Gene copy number Microbiome surveys

Microbiome：变形菌门解释肠道菌群可变性

不同肠道菌群之间为什么会有生理差异的特异性基因及分类群呢？菌群的可变性主要与哪些类型的细菌有关？看看这篇文章。

拟杆菌门肠型厚壁菌门功能冗余人体肠道微生物