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Konstantinos T Konstantinidis
文章数:5篇
微生物命名
Nature子刊:命名不可培养的古菌和细菌的两条路径(共识)
随着DNA测序技术的广泛应用,人们发现了大量不可培养的古菌和细菌,对于这些原核生物的命名目前仍缺少清晰、稳定的规则。为解决这一问题,在Nature Microbiology上发表的一篇共识声明文章提出了包含两条路径的路线图,并呼吁学界共同努力来完善和推进相关工作,推荐专业人士参考。
微生物命名
细菌
古菌
共识声明
病毒鉴定
Nature:宏基因组学解析巨病毒的多样性及与宿主的相互作用
巨病毒(Giant virus),属于核质大DNA病毒(nucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDVs),基因组可以达到几个兆碱基大小,病毒体甚至比小细胞生物体尺寸类似甚至更大。这些病毒能够广泛地感染从原生生物到动物等一系列真核生物。但是目前关于巨病毒的了解还仅限于与原生生物和藻类共生的病毒分离株。发表在《Nature》上的一项研究,基于目前公开的众多宏基因组数据,重建了2000多种NCLDV基因组,并分析了其分布模式、代谢特点及与宿主的相互作用。该研究为未来巨病毒的研究提供坚实的基础理论和广泛的资源,为巨病毒多样性以及其与宿主的相互作用提供了更为全面的分析和见解。
病毒鉴定
核质大DNA病毒
宏基因组
水平基因转移
代谢重编程
饮用水菌群
是时候关注饮用水微生物组了
世界各地的自来水中含有大量的微生物,据估计每升水中含有的微生物细胞个数可在10^6-10^9之间。这些微生物与饮用水的质量和公共卫生风险密切联系,但是对其生物学特性的研究仍然较为滞后。《Trends in Microbiology》发表观点文章,提议有必要关注饮用水菌群。
饮用水菌群
Microbiome
meta-omics
Drinking water
microbial ecology
抗生素耐药
非抗生素类杀菌剂也会筛选抗生素耐药性
苯扎氯铵作为非抗生素类杀菌物质被广泛运用于食品生产、药物生产和家用领域,但该物质对于细菌的抗生素耐药性具有共筛选作用。本研究阐释了环境细菌在苯扎氯铵使用条件下被筛选出的多种抗生素耐药机制,强调了对苯扎氯铵的使用和排放进行有效监管的必要性,值得专业人士关注。
抗生素耐药
苯扎氯铵(BAC)
耐药性共选择
P Arner
K L Spalding
宏基因组序列分类
在基因组水平进行分类学和基因多样性分析的新工具
Nucleic Acids Research近期发表文章,介绍了一个新型在线分析工具,以宏基因组等多种基因组数据为输入,对古菌和细菌进行分类学和基因多样性分析,比16S rRNA有更高的分辨率,推荐给有需要的专业人士。
宏基因组序列分类
在线工具
Domenico Praticό
Antonio Di Meco