Sang Yup Lee

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Sang Yup Lee

文章数：4篇

微生物系统代谢工程

Nature子刊：微生物系统代谢用于食品和化妆品生产（综述）

随着全球人口快速增加和气候变化，可持续和环境友好型的食物和化妆品越来越被需要。微生物是生产各种食物和化妆品成分的潜力细胞工厂。但是，基于微生物的食品和化妆品成分商业化仍然受微生物菌株和加工的限制，而系统代谢工程可以提高微生物的表现。发表在Nature Reviews Bioengineering的本文强调了微生物可以生产的食物和化妆品成分，讨论了系统代谢工程中不同阶段产物模式和宿主选择、代谢途径重塑、耐受度提高、代谢流和发酵过程优化、下游加工整合和规模化等对微生物生产食品和化妆品成分的影响和优化，并指出了现有局限和未来发展方向，值得相关人士学习。

微生物系统代谢工程综述

Nature子刊：使用合成sRNA可在不同细菌中进行靶向和高通量基因敲除

目前，sRNA因其可实现在翻译水平上敲低目的基因表达而备受关注。然而有限的适用菌种范围限制了其应用。近日，韩国研究人员在Nature Communications发表最新研究，使用枯草芽孢杆菌的RoxS的骨架和Hfq分子伴侣构建了适用于广泛宿主的sRNA平台，该系统可在多种菌种同时敲低多个基因，证明了其适用性的广泛和高效。总之，该研究表明BHR-sRNA平台是一个有效、快速、准确的合成生物学和代谢工程工具，值得关注。

合成sRNA 基因敲除研究论文基础研究枯草芽孢杆菌

将大肠杆菌改造为天然产物的合成工厂（综述）

工程菌可用于天然产物的大规模生产，《Trends in Biotechnology》发表的这篇综述文章详细介绍了改造大肠杆菌以产生特点天然产物的代谢工程策略、代表性例子以及前景和挑战。

工程菌天然产物 E. coli systems metabolic engineering natural products

antiSMASH数据库

antiSMASH数据库2—次级代谢物基因簇预测

源于微生物的天然产品经常用于抗菌和抗癌药物、杀虫剂、除草剂或杀菌剂。近二十年来，基因组数据的不断增加，使通过基因组挖掘来获取化合物的生物合成簇成为可能。antiSMASH是该领域最流行的工具之一。自2011年首次发布以来，antiSMASH已成为次级代谢产物基因组挖掘的标准工具，antiSMASH数据库为许多公开可用的微生物基因组提供预先计算的antiSMASH结果，并允许进行高级跨基因组搜索。目前是该任务最广泛使用的软件流程，引用超3000次。

antiSMASH数据库次级代谢产物预测注释基因簇