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文章数：3篇

代谢建模助力研究宿主-菌群互作（综述）

复杂微生物群落内部及其与宿主之间的相互作用对于宿主的健康起到重要的作用，肠道菌群主要通过其分泌的代谢产物相互交流，代谢产物的分泌又取决与菌群所处的环境以及菌之间的互作，因此，鉴定出微环境中单个菌分泌的代谢产物至关重要。Microbiome上发表的一篇文章，通过将单菌及其产生的代谢微环境放置在一个小室，从而将菌之间、菌和宿主细胞之间进行分离，再将每个单菌的小室放置于多菌共享的环境中，达到模拟菌群之间的代谢互作的效果；结合不同的实验方法及计算机模拟方法，能更好的理解微生物间以及和宿主的复杂代谢网络互作，为肠道健康的代谢调控提供了新的见解。

代谢互作计算机建模代谢网络宿主-菌群互作研究论文

BioCyc使用的新帮手：MORS

这是一篇来自BioCyc基因/代谢路径数据库团队的文章，介绍了一个新的工具软件MORS来帮助使用者更好的利用BioCyc数据库。MORS可以较为精准的快速模拟出跨物种的代谢物途径，并对研究中常见的起始或终止代谢物未知的情况作出允许添加一系列候选代谢物调整，甚至将13种常见的中间产物列在SmartTable中供使用者参考。建议有需要的读者试一试！

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Microbiome：饮食改变造成瘤胃菌群代谢网络的变化

① 将绵羊分为两组，分别喂食以谷物为基础的饮食及以草料为基础的饮食；② 谷物饮食组的绵羊瘤胃菌群代谢网络中，能够利用具有更短的碳链骨架的底物的部分更少；③ 谷物饮食组的绵羊瘤胃菌群代谢网络复杂性更低，个体之间的相似度更高；④ 两组绵羊在实验开始前均喂食以草料基础的饮食，因此作者认为饮食变化驱动了不同的菌群代谢网络的出现，包括以无法有效利用饮食营养为特征的网路退化。

瘤胃菌群代谢网络