单核苷酸变异 (SNV)

搜索
登录

单核苷酸变异 (SNV)

文章数：5篇

菌株多样性

菌株水平多样性的改变会影响蜜蜂肠道群落的功能潜力？

菌株水平的多样性在细菌物种中广泛存在，可以扩大天然微生物群落的功能潜力。然而，群落在多大程度上因环境/宿主变化而经历菌株组成的持续变化尚不清楚。近日，瑞士洛桑大学研究人员在Genome Biology发表最新研究，使用宏基因组学探究蜜蜂两种行为状态（护士蜂和采集蜂）肠菌差异，发现宿主相关群落中的菌株水平多样性可以随着宿主行为变化而发生一致的变化，从而调节群落的功能潜力，值得关注。

菌株多样性肠菌功能潜力研究论文基础研究宏基因组学

肠道炎症期间常驻细菌如何进化并影响临床结果？

炎症性肠病是一种影响胃肠道的持续性炎症，在其管理和治疗方面提出重大挑战。尽管我们知道宿主内的细菌进化发生在肠道内，但很少从进化的角度研究这种疾病。近日，基尔大学研究人员在Gut Microbes发表最新研究，基于IBD无菌小鼠模型探究大肠杆菌体内进化规律，发现大肠杆菌在炎症性肠病的小鼠模型中的演变会导致疾病特异性细菌基因型和具有临床相关性的权衡，值得关注。

细菌演化炎症性肠病研究论文基础研究肠道菌群

朱立新+刘占举+朱瑞新等：基于肠菌基因的炎症性肠病AI诊断模型

炎症性肠病与肠道菌群关系非常密切，可作为一种有前途的非侵入性诊断工具。近日，同济大学朱瑞新、中山大学六院朱立新、上海市第十人民医院刘占举、中山大学附属第六医院贺青及团队在Gut Microbes发表最新研究，整合了来源于多中心的CD和健康对照共1418例样本的粪便微生物测序数据，全面描绘了CD患者中微生物多维度特征的变化模式，利用AI构建了微生物多维度诊断模型，评估了各个维度特征诊断潜能的优劣，以鉴定最优诊断模型，并验证其疾病特异性，值得关注。

疾病诊断人工智能研究论文基础研究微生物物种

诊断标志物

iMeta：张家超团队建立基于肠道菌群单核苷酸变异基因标记物的IBD预测模型

肠道菌群是炎症性肠病（IBD）发生发展的重要环境因素。海南大学张家超团队近期在iMeta发表研究，在IBD患者的肠道菌群中发现了基于单核苷酸变异（Single nucleotide variants, SNV）的特异性基因特征，建立了一种新的准确预测IBD的诊断方法。

诊断标志物炎症性肠病(IBD) 肠道菌群宏基因组单核苷酸变异 (SNV)

宏基因组菌株检测

使用 SameStr 进行宏基因组菌株检测：识别可通过粪便移植转移的持久核心肠道菌群

作者开发了 SameStr，一种生物信息学工具，其能够检测宏基因组样本中共享菌株，提供了对宏基因组序列数据中共享菌株的稳健识别，具有足够的特异性和敏感性，以检查人类粪便菌群中的菌株持久性、转移和植入。作者的研究结果确定了一个持久健康的成人核心肠道菌群，且应进一步研究以阐明菌群对慢性疾病的贡献。

宏基因组菌株检测核心肠道菌群共享菌株单核苷酸变异 (SNV) 粪便菌群移植 (FMT)