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文章数:2篇
人类肠道病毒组
Cell子刊:研究人肠道病毒组的重要新资源
目前关于人肠道病毒组的研究至少发表了32项,但不同研究之间存在不一致的结果。Cell Host and Microbe发表的一项新研究中,美国俄亥俄州立大学的研究者对这32项研究的数据进行了整合,构建了一个系统性的人肠道病毒组数据库,用其评估了这些研究的偏倚性和不同研究方法对病毒数据的影响,并分析了人一生中的病毒组演变规律。该研究为今后的肠道病毒组研究提供了重要资源。
人类肠道病毒组
gut microbiome
Virome
database
Bacteriophage
宏基因组数据库
中山大学:人类肠道宏基因组数据库gutMEGA
为了方便科学家查询和检索已发布的肠道菌群宏基因组测序数据,在这项研究中,中山大学第一附属医院的Xiaoxing Li和中山大学附属肿瘤医院的Ze-Xian Liu与团队,开发了肠道宏基因组图谱(gutMEGA),这是一个注释齐全的综合数据库,用于管理和托管来自人类已发表的肠道菌群定量数据集。通过仔细整理肠道菌群的组成,表型和实验信息,gutMEGA最终在776个条件下整合了7种不同水平(界,门,纲,目,科,属和种)的6457类群的59132个定量信息。此外,通过各种浏览和搜索功能,gutMEGA为用户提供了一种快速简便的方法来获取表型之间肠道微生物的相对丰度。总体而言,gutMEGA是用于肠道宏基因组研究的便捷而全面的资源,可以从 http://gutmega.omicsbio.info 免费访问。
宏基因组数据库
Gut microbiota
human health
metagenomics
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