单细胞组学

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单细胞组学

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单细胞组学

研究微生物生态学，单细胞组学很关键（综述）

单细胞组学方法在微生物生态学研究中受到的关注越来越多。Trends in Ecology and Ecolution发表的这篇综述，讨论了单细胞组学在微生物生态系统和生态进化学研究中的应用。

单细胞组学菌群微生物生态学

北京朝阳医院：中国溃疡性结肠炎患者特有的细胞亚群

溃疡性结肠炎（UC）是一种慢性炎症性疾病。该病主要在欧美等国家流行，然而近年来，随着生活水平的提高以及临床检测能力的提升，我国的UC呈逐年递增。目前无论是基于全基因组测序关联分析（GWAS）还是转录组分析，或是单细胞测序分析等对于UC的大数据研究基本都是基于欧美的人群，真多我国人群的相关研究仍然欠缺。近期首都医科大学附属北京朝阳医院刘心娟团队针对5名中国UC患者，进行了单细胞测序的研究，填补了这一空白。他们研究发现，尽管中国UC患者的单细胞亚群和相关UC特征基因的表达的基本趋势与欧美研究结果一致，但是在中国UC患者中发现了两个新的与UC相关的细胞亚群。此外，研究还发现差异基因表达在UC和正常人相比与UC患者正常组织和病变组织相比存在细胞类群的不同。前者的差异主要在免疫细胞中，而后者的差异更多的出现在上皮和基质细胞中。

UC 浆细胞溃疡性结肠炎（UC）单细胞测序研究论文

单细胞组学

单细胞组学：如何利用细胞内部特征和病人特点研究消化道与疾病？（综述）

单细胞组学是基于二代测序、质谱及成像的新生技术，由于实验方案还具瑕疵降低了可重复性、大数据分析对生信和计算机相关专家要求高、花费和整套分析时程长等原因仍处于发展阶段，特别是在地方诊所做到直接采集并制备高质量样品仍是挑战。但作为精准医疗的基石，单细胞组学临床应用前景巨大。Gastroenterology上发表的一篇综述介绍了单细胞转录组（scRNA-seq）、基因组、单细胞表观基因组（sc-Hi-C）、蛋白组、代谢组学（MALDI）的相关技术进展和在消化道疾病如结直肠癌（CRC）和IBD研究中的应用。文章提出整合多组学分析单细胞特征并最终应用于临床诊断、治疗、预后是该领域研究的下一个前沿。

单细胞组学 heterogeneity Transcriptomics proteomics metabolomics