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gut virome
文章数:3篇
早期断奶仔猪
陶诗煜+魏泓:早期断奶仔猪肠道病毒群有何特征?
仔猪断奶早期由于本身免疫力和消化机能较弱、或饲养管理不适就容易发生腹泻现象,腹泻会增加仔猪死亡率、降低仔猪生长性能、严重危害畜牧业。目前,对早期断奶仔猪肠道菌群的研究几乎只集中在细菌上,而对肠道病毒群的研究极其缺乏。近日,华中农业大学的陶诗煜、魏泓及团队在Microbiology spectrum发表最新研究,采用宏基因组和宏转录组测序结合生信技术,揭示早期断奶仔猪肠道DNA和RNA病毒群的生物多样性、结构和组成,发现早期断奶健康和腹泻仔猪肠道病毒整体结构相似,但腹泻仔猪肠道中存在更多病毒种类和生态多样性。总之,该研究为未来制定有效策略干预仔猪早期腹泻提供了新指导。
早期断奶仔猪
肠道病毒群
early weaning
gut virome
metagenome
人类肠道病毒组
于君团队:人肠道病毒组超深度测序,发现1058种新病毒
缺少病毒参考基因组是病毒组研究面临的一大挑战。香港中文大学于君团队近期在Gastroenterology发表研究,通过改良病毒DNA提取,结合基于三代和二代测序的超深度宏基因组测序,以及配套的生信分析流程,从健康人粪便中解析出1058种基因组完整的新病毒,并对这些病毒基因组进行了多角度分析。这些发现可助力疾病诊断、扩充病毒参考基因组,为进一步开展病毒组研究作出贡献。
人类肠道病毒组
三代测序
PacBio测序
超深度宏基因组测序
诊断标志物
肠道病毒组
张文+沈权:病毒宏基因组学分析揭示高原蜥蜴肠道病毒组
江苏大学张文、沈权等近期在Microbiology spectrum发表研究,首次揭示了高原蜥蜴肠道病毒组独特的结构和功能特征,为进一步研究这些濒危蜥蜴物种及其他变温动物和高原动物的肠道病毒组奠定基础。
肠道病毒组
蜥蜴
青藏高原
Qinghai-Tibet Plateau
Bacteriophages