染色质可及性

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染色质可及性

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南京大学iMeta：用于构建基因动态调控和网络的整合分析平台

南京大学陈迪俊团队在iMeta发表研究，推出了cisDynet，旨在利用染色质可及性数据为顺式调控动态和基因调控网络建模, cisDynet使用 Snakemake 和 R 函数将数据预处理和高级下游分析功能结合在一起。cisDynet 为研究人员提供了一个用户友好型解决方案，最大限度地减少了编程的需要，确保了结果的可重复性，并大大简化了表观基因组数据的探索。

ATAC-seq 染色质可及性基因表达全基因组关联分析（GWAS）调控网络

染色质可及性增加驱动右侧结肠癌发展的新机制

表观遗传机制与肿瘤发生发展和肿瘤异质性密切相关。染色质压缩缺陷导致基因组不稳定性增加和特定基因的异常激活。结直肠癌基因组中存在全局的DNA甲基化减少，与肿瘤位置和预后相关。德国法兰克福大学Florian R. Greten团队近日在Gastroenterology发表研究文章，发现赖氨酸甲基转移酶SUV420H2介导的H4K20me3对维持染色质压缩状态是不可或缺的，该过程的缺失可驱动右侧结肠癌的进展及转移，揭示了表观遗传机制影响结直肠癌发展的新途径，也为治疗右侧结肠癌提供了新的思路。

结直肠癌表观遗传染色质可及性右侧结肠癌患者来源的类器官（PDO）