Viral evolution

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文章数：3篇

狗可能是新冠病毒的中间宿主吗？

抗病毒锌指蛋白（ZAP）可特异性结合CpG以降解RNA病毒的基因组。许多哺乳动物RNA病毒进化出了CpG缺陷。Molecular Biology and Evolution上发表的一项最新研究，通过对病毒RNA基因组中的CpG比例进行研究，发现新冠病毒SARS-CoV-2与蝙蝠冠状病毒（BatCoV RaTG13）及犬冠状病毒（CCoV）相似，均有着极低的基因组CpG比例，并据此提出了一种观点：犬科动物（例如流浪狗）可能是新冠病毒的中间宿主。虽然该研究的结论引发了一些质疑与争议，但仍为寻找SARS-CoV-2的中间宿主、病毒防御和疫苗研究提供了重要思路。

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宿主-病原体互作

流感病毒提醒你该减肥了

肥胖已成为全球性“流行病”，全球50%的成年人超重或肥胖。肥胖会带来一系列健康风险，如导致II型糖尿病、代谢综合征、心血管疾病和各种癌症等，但肥胖的影响不止于此。《mBio》上的一项小鼠研究显示，当病毒在肥胖小鼠之间传播时，少量突变体在肥胖小鼠中迅速出现，并且表现出更强的复制能力，从而导致肥胖小鼠来源的病毒在感染野生小鼠时表现出更强的毒力。该研究表明肥胖微环境是导致流感病毒致病性增加的因素之一，为人们理解病毒进化和预防流感病毒感染提供了理论指导。

宿主-病原体互作 NHBE influenza interferons Obesity

Nature Reviews：噬菌体的多样性、基因组与进化（综述）

病毒宏基因组学的最新进展使人们能够在从人类肠道到深海的众多环境中迅速发现空前的噬菌体目录。尽管这些进展扩大了我们对噬菌体基因组多样性的理解，但也表明我们的研究相当初步。尽管噬菌体在核苷酸序列水平上具有非常高的多样性，但形成病毒颗粒的结构蛋白仍具有很强的相似性和保守性。从进化的角度来看，噬菌体具有独特的相互联系，并响应宿主的选择性压力而经历多种基因交换事件，从而驱动了它们的多样性。本篇Nature综述介绍了噬菌体在结构，基因组和群落水平上的多样性，以及噬菌体之间复杂的进化关系，这些噬菌体是由其基因组的镶嵌性塑造的。强烈推荐阅读，是噬菌体领域同行的必读入门教科书。

噬菌体 Bacteriophages biodiversity metagenomics Phage biology