Yoshihiko Tomofuji

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Yoshihiko Tomofuji

文章数：5篇

Cell子刊：关联分析揭示肠道菌群与宿主间的相互作用

肠道菌群与宿主之间的相互作用在人类健康中发挥着关键作用。近日，发表在Cell Reports上的这篇文章，通过肠道宏基因组测序、非靶向代谢组分析、单核苷酸多态性（SNP）阵列和全基因组测序，评估肠道菌群与宿主遗传学和血浆代谢物的关联，将为了解代表性不足的人群中肠道菌群与宿主相互作用提供有用资源。

Nature子刊：利用肠道宏基因组测序数据或可重建宿主信息

粪便样本中存在的人类 DNA 会导致肠道鸟枪法宏基因组测序数据中出现少量的人类reads。然而，目前尚不清楚有多少个人信息可以从这些reads中重建出来，而且还没有进行定量评估。近日，日本大阪大学研究人员在Nature Microbiology发表最新研究，从343名日本人肠道宏基因组中重建个人信息。基于人类对肠道宏基因组数据的reads，开发了一种从基因型数据集中重新识别个体的方法。通过计算可能性得分，可有效利用肠道宏基因组中的少量reads，量化肠道宏基因组数据中包含的个人信息，值得关注。

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肠道宏基因组

Cell子刊：日本人的肠道菌群与饮食及疾病的关联

Cell Genomics上发表的一项最新研究结果，从787个日本人的肠道宏基因组中，重建了近2万个原核生物基因组，以及超过3万个病毒基因组，揭示了肠道细菌及病毒与饮食、种族及疾病的关联。

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噬菌体-菌群-免疫互作

肠道噬菌体与菌群的互作，或影响自身免疫病

Annals of the Rheumatic Diseases上发表的一项病例-对照研究结果，对476名日本受试者的肠道病毒组进行分析后发现，crAss样噬菌体的丰度与类风湿关节炎（RA）及系统性红斑狼疮（SLE）相关，而短尾噬菌体科的丰度与SLE相关。另外，短尾噬菌体科与粪杆菌属之间存在共生关联，而后者产生的短链脂肪酸具有抗炎活性。该研究结果提示，肠道病毒组可能通过与肠道细菌的互作影响自身免疫疾病的发生发展。

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系统性红斑狼疮

日本SLE患者的肠道菌群组成及功能特征

肠道菌群变化与系统性红斑狼疮（SLE）的发病机制相关。Annals of the Rheumatic Diseases上发表的一项最新研究，通过宏基因组关联分析，对比鉴定了SLE患者与健康对照之间的肠道菌群组成及功能差异，并通过整合GWAS及血浆代谢产物数据，揭示了SLE特异性菌群特征与宿主基因组及代谢产物的关联。

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