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本周精选
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Cell：复杂且明确的合成人类肠道菌群模型
Cell最新发表了斯坦福大学Michael Fischbach和Kerwyn Huang团队的研究论文，成功构建了一个人肠道微生物来源的、物种组成明确、结构复杂的群落hCom2。hCom2能反应人肠道微生物组的大部分生物学特性，并且该群落组成稳定，对病原体定植有很强的抵抗力，该模型或有助于对影响宿主健康的基因、微生物种类进行机制研究。未来需进一步完善该群落，包括增加细菌菌株以占据空的生态位，以及古细菌、真菌和病毒等肠道中的其它重要物种。 2022-09-07 | |
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吕梦泽等Nature：ILC3调控菌群特异性Treg建立肠道耐受
RORγt+细胞在肠道中协调免疫、炎症和耐受。在IBD、免疫缺陷病毒感染和癌症等多种疾病中RORγt+免疫细胞的数量或功能均发生显著改变。但RORγt+免疫细胞的全谱细胞异质性、亚群之间功能相互作用的潜力以及在复杂肠道菌群的背景下建立免疫耐受所必需的途径仍然不清楚。Nature最新发表了来自美国康奈尔大学威尔康奈尔医学院Gregory Sonnenberg团队、吕梦泽博士作为共同一作的一项研究，表明LTi样ILC3细胞调控RORγt+Treg细胞和Th17细胞，以协调对菌群的免疫耐受，扩展了我们对RORγt+细胞调控肠道健康的理解。 2022-09-08 | |
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Nature：RORγt+抗原呈递细胞驱动菌群特异性Treg分化
肠道菌群与免疫互作维系机体耐受和促炎之间的平衡。其中调节性T细胞（Treg）、TH17和滤泡辅助T细胞（TFH）是重要组分。Nature最新发表纽约大学医学院Dan Littman团队的文章，鉴别出掌控肠道菌群信号、联系T细胞并决定其分化的一种独特抗原呈递细胞（APC），Cd11c谱系、RORγt+ APC。 2022-09-08 | |
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Nature：生命早期建立肠道免疫耐受，一类新型抗原呈递细胞很关键
胸腺髓质上皮细胞（mTEC）表达自身免疫调节因子（Aire），是建立对自身抗原免疫耐受的关键。除了胸腺，肠道淋巴组织是另一个诱导免疫耐受的主要部位，通过诱导外周调节性T细胞（pTreg），在生命早期建立对菌群和食物抗原的耐受。然而，哪些抗原呈递细胞（APC）介导了生命初期的pTreg分化，尚不清楚。Nature最新发表了来自美国纪念斯隆凯特琳癌症中心Chrysothemis Brown和Alexander Rudensky团队的研究，发现并详细分析了肠道淋巴结中的一类表达RORγt的新型抗原呈递细胞——Thetis细胞（TC），揭示了其在生命早期肠道pTreg诱导和对共生菌群的免疫耐受建立中的关键作用。 2022-09-08 | |
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Nature：降解胰蛋白酶的肠菌，为肠道健康保驾护航
肠道是一个“大熔炉”，不仅暴露于各种饮食和微生物分子，还要容纳宿主产生的消化酶（如胰蛋白酶）。这些酶在小肠的营养物质消化中发挥关键作用，但在大肠中却是不受欢迎的，其水平和活性的异常升高可能破坏肠黏膜屏障，促进肠道疾病。Nature最新发表了日本理化学研究所（RIKEN）Kenya Honda和Koji Atarashi团队与美国哈佛医学院麻省总医院Ramnik Xavier团队的合作研究，鉴定出能降解胰蛋白酶的肠道细菌，揭示了其背后的分子机制，以及对宿主肠道免疫（如抗感染）的重要作用。 2022-09-08 | |
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Nature：为什么喜欢富含油脂的食物？揭示关键的肠-脑通路
喜欢富含油脂和脂肪的食物，是人类和很多动物的天性。Nature最新发表了来自哥伦比亚大学Charles Zuker团队的研究，发现这种对脂肪的喜好并不依赖于味蕾，而是由肠-脑神经通路所介导，并揭示了其中的神经和分子机制。 2022-09-08 | |
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小鼠or类器官？6大案例了解人源化模型新进展
人源化动物模型和器官芯片模型不断进步。 2022-09-10 | |
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5大案例，快览噬菌体最新前沿应用
它因抗生素而被忽视，又因抗生素而被重视。 2022-09-06 | |
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热心肠智库
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石汉平+孙强+周福祥：代谢亚型或可指导结肠癌是否可用生酮饮食治疗
首都医科大学附属北京世纪坛医院的石汉平、中国医学科学院的孙强和武汉大学中南医院的周福祥作为共同通讯作者在Advanced Science上发表文章，报道了与生酮饮食（KD）治疗结肠癌相关的两种代谢亚型，发现代谢亚型能够指导结直肠是否能接受KD治疗，揭示出靶向突变型p53和KD治疗协同抑制肿瘤生长。 2022-09-12 | |
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马郁芳+马骁驰：肠道宏病毒组扩增和测序方法的优化及评价
大连医科大学马郁芳和马骁驰团队在Journal of Advanced Research发表了最新研究，建立了一种优化的、可重复的宏病毒组扩增和测序工作流程，并结合二三代混合测序策略，有效提升了宏病毒组的组装性能，为未来在基因组水平研究复杂的肠道病毒群落提供了有效的方法支撑。 2022-09-10 | |
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iMeta：华科宁康等建立中药成分鉴定和药理学挖掘的在线平台TCM-Suite
华科宁康等建立中药成分鉴定和药理学挖掘的在线平台TCM-Suite，TCM-Suite平台由两个子数据库 Holmes-Suite和 Watson-Suite组成的 ，分别用于中药生物成分鉴定和网络药理学研究。TCM-Suite是一个全面的搜索和分析平台，可用于传统中药的药物发现和再利用。 2022-09-10 | |
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两岸团队携手突破：人工智能辅助评估结肠镜检查前的肠道准备
充分的肠道准备是结肠镜检查成功的关键。南方医科大学深圳医院的龚伟、夏瑰丽与厦门大学附属中山医院的许鸿志作为通讯作者，厦门长庚医院吕元博作为第一作者，携手台湾省长庚纪念医院团队，在American Journal of Gastroenterology上发表的一项随机单盲对照试验结果，开发了一种新型人工智能卷积神经网络（AI-CNN）模型，可用于评估肠道准备质量。 2022-09-09 | |
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刘洋彧等Nature子刊：利用MAGs剖析人类肠道菌群在新冠中的作用
近日，哈佛大学医学院刘洋彧及团队发表在Nature Communications的最新研究，纳入六个独立队列共514个新冠肺炎相关的鼻咽和粪便样本，通过重建宏基因组组装基因组（MAGs）探究人类肠道菌群在新冠中的作用，获得了11584个MAGs。发现新冠患者多种物种的菌株丰富度显著降低，相关代谢途径和健康个体也不同，值得关注。 2022-09-09 | |
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何彦团队：肠道菌群的衰老轨迹与代谢疾病和年龄相关
衰老是不可抗拒的自然规律，肠道菌群也会伴随年龄增长出现衰老。然而，人类肠道菌群的衰老速度可能不同，出现加速或延迟现象。菌群的衰老轨迹是否可以用作成人代谢疾病的生物标志物呢？针对这一问题，南方医科大学珠江医院何彦教授团队在Gut上发表的一项最新研究揭示，肠道菌群的衰老轨迹可能成为儿童和成人慢性疾病的潜在生物标志物，但应考虑年龄和代谢疾病等因素的影响。 2022-09-08 | |
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袁慧娟团队：绝经后骨质疏松症患者的肠道和阴道菌群变化
河南省人民医院袁慧娟团队近期在Frontiers in Immunology发表研究，探索了肠道和阴道菌群与绝经后骨质疏松症（PMO）的关联，表明绝经后妇女的骨密度变化与肠道菌群和阴道菌群的变化有关，而肠道菌群与PMO的关联更为紧密，为进一步研究菌群与PMO之间的因果关系和机制提供了方向。 2022-09-07 | |
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祁斌团队Cell子刊：大肠杆菌激活宿主食物消化系统新机制
近日，云南大学祁斌团队在Cell Host and Microbe发表文章，通过建立线虫食物消化研究体系，揭示大肠杆菌膜蛋白OmpA/F通过多巴胺和NLP-12-CCKR-1抑制先天免疫p38/MK-1通路，从而激活动物食物消化系统。这项研究揭示细菌OMP在调节动物营养吸收以及先天免疫中的关键作用。 2022-09-07 | |
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何菁+王军+栗占国等：扁桃体菌群如何维持免疫平衡？
近日，北大人民医院何菁、栗占国和中国科学院微生物所王军及团队在Advanced Science发表最新研究，发现类风湿关节炎患者（RA）扁桃体抗菌肽salivaricin合成明显减少，会进一步引起Tfh异常分化和IL-21过度表达，可能是患者自身免疫反应异常的诱因之一。通过关节炎小鼠模型发现，证实salivaricin具有预防和治疗实验性关节炎的作用。总之，该研究为自身免疫病的治疗提供了新的治疗靶点及理论依据。 2022-09-06 | |
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热心肠日报
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第2294期：菌群“坏”代谢物增强肿瘤免疫治疗？Science子刊再发新证
话题：胰腺癌，TMAO，结直肠癌，生酮饮食，ctDNA，结直肠癌肝转移，B细胞，CT影像组学。 2022-09-12 | |
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第2293期：五文连发！BMJ多视角聚焦循证营养
话题：超加工食品，人工甜味剂，维生素D，新冠，饮酒，结直肠癌，皮肤癌，丙烯酰胺，乳腺癌，坚果，膳食纤维。 2022-09-11 | |
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第2292期：土壤菌群对人类健康有多重要？15页《自然·综述》深度阐述
话题：土壤菌群，菌群分析方法，病毒组，真菌组，预测模型，肠道芯片，中药。 2022-09-10 | |
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第2291期：86分综述详解：早期肠道菌群与儿童呼吸道疾病有何关系？
话题：婴儿肠道菌群，呼吸道疾病，新冠，智能手机，关节炎，致病菌，乳腺癌，肠道准备，小肠移植。 2022-09-09 | |
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第2290期：今日Nature五连发：肠菌与免疫+肠脑多点突破
话题：免疫耐受，Treg，抗原呈递细胞，胰蛋白酶，肠脑轴，分泌型抗体，衰老，演化，微生物源脂质。 2022-09-08 | |
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第2289期：今日Cell：超复杂合成菌群，为肠道菌群研究再添新利器
话题：合成菌群，食物消化，器官移植，胆汁酸，肠屏障，脂肪肝病，抗衰老，骨质疏松。 2022-09-07 | |
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第2288期：免疫细胞迁移：肠道如何成为炎症性疾病的“核心”？
话题：免疫细胞迁移，乳糜泻，扁桃体菌群，肠道超声，IBD，钙卫蛋白，NSAID，菌群-免疫互作。 2022-09-06 | |
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肠道产业
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活菌药决赛圈拉开序幕，Seres完成滚动上市申请
NTCD-M3 3期临床开发获EMA积极回复，Obefazimod 治疗UC2b期诱导试验结果发表，PL8177 2期临床患者招募启动，APT发起The AMR RAPID挑战赛，百葵锐生物获投5000万。 2022-09-11 | |
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儿童便秘怎么办？首个FDA批准的治疗儿童功能性便秘药物或将到来
恒天然推出纽添益品牌，致善生物创业板IPO成功过会，Gensaic宣布与Ovid达成合作，欧盟否决Illumina对Grail的收购，Vernalis与Unison达成研发合作。 2022-09-09 | |
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37家医疗器械与诊断企业2022年中报，疫情之下何去何从？
医疗器械行业2022年上半年发展态势如何？ 2022-09-08 | |
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利用极端微生物提高作物产量，初创企业获投2570万元
Finch大幅裁员37%并暂停临床试验，Chobani撤回IPO申请，大北农终止收购九鼎科技，mazdutide 2期临床完成首例给药，诺维信与江南大学成立益生菌联合实验室。 2022-09-07 | |
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3.39亿元！新锐获巨额资助，支持溃疡性结肠炎创新药迈入3期
Azurity公司Konvomep获FDA批准，Avails Medical获投170万美元，EpiEndo开启EP395临床试验，ADM中国科学技术中心投入运营，雀巢晟明花园扩展细分产品线。 2022-09-05 |
