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Human gut
文章数:4篇
肠道古菌组
韩国人的肠道古菌组中,嗜盐古菌很丰富
古菌是人体肠道菌群的组成部分,但对肠道古菌组的研究仍比较有限,此前研究认为产甲烷古菌可能是人肠道中最主要的古菌类型。Microbiome近期发表的一项研究分析了韩国人的肠道古菌的丰度和多样性,表明嗜盐古菌在肠道古菌组中广泛存在,并根据优势古菌的种类划分出4种古菌肠型。
肠道古菌组
Human gut
Population-level metataxonomic analysis
archaeome
Haloarchaea
人体肠道微生物
探究人体肠道细菌和古菌共生的代谢基础
人类肠道微生物的组成非常复杂,其中大部分是细菌,还有一部分古菌。细菌Christensenellaceae(克里斯滕森菌科)和古菌Methabacteriaceae(甲烷短杆菌科)在人类肠道中广泛存在。这两个科的物种间相互作用以及它们对人体健康的影响尚不明确。《mBio》上发表的一项研究发现,由细菌C. minuta(小克里斯滕森菌)产生的氢气可作为古菌M. smithii(史氏甲烷短杆菌)产甲烷的底物,从而实现二者在肠道内的共生,且这种氢气的种间传递广泛存在于在低BMI人群中丰度较高的克里斯滕森菌科和甲烷短杆菌科之间,表明二者的肠道内共生可能对人体有一定健康作用。
人体肠道微生物
共生
Human gut
methanogens
Microbiome
结直肠癌
特定真菌分泌蛋白或能作为大肠癌标记物
许多研究关注了结直肠癌患者肠道中的菌群组成异常,但较少研究关注患者肠道菌群的分泌蛋白组变化。Gut Pathogens上发表的一项最新研究,对比了健康人与结直肠癌患者的肠道菌群分泌蛋白组,鉴定出了大量来自粟酒裂殖酵母的分泌蛋白,以及健康人与患者的分泌蛋白组差异。
结直肠癌
Schizosaccharomyces pombe
Human gut
Microbiome
Secretome
宏基因组学
孙凤珠等:从宏基因组数据中更有效“捞出”病毒数据的方法
这是美国南加州大学孙凤珠团队开发的机器学习方法,能够在宏基因组数据中更准确鉴定出病毒数据,很酷的生物信息学突破,特别推荐!
宏基因组学
病毒序列
生物信息学工具
机器学习
肝硬化