metabolic pathways

搜索
登录

metabolic pathways

文章数：6篇

Nature子刊：gutSMASH助力评估肠道菌群特定代谢潜力

肠道菌群可产生数百个小分子，其中许多参与调节宿主生理机能，虽然目前已经努力鉴定代谢产物的生物合成基因，但肠道菌群的化学输出主要由初级代谢产物组成。近日，荷兰瓦赫宁根大学、美国斯坦福大学研究团队，傅静远教授和陈连民教授作为共同作者，在Nature Biotechnology发表最新研究，开发了一种新工具gutSMASH（https://github.com/victoriapascal/gutsmash），通过预测肠道微生物组中已知的和新的代谢基因簇（MGC），系统地评估肠道菌群的代谢潜力，在4240个高质量基因组中共鉴定到近2万个代谢基因簇（MGC），gutSMASH还识别到不同菌属的能量捕获机制也存在显著的差异。此外，通过人群大队列验证，发现血液/粪便的菌群衍生代谢物水平与相应代谢基因的宏基因组丰度相关性很弱。总之，该工具不仅可以预测已知功能的MGC，还可以预测可能代表进一步实验表征的良好候选者的新型 MGC，值得测试。

gutSMASH 初级代谢产物研究论文基础研究代谢基因簇

缺血性中风

特定菌群特征可能在中风中起到保护作用

来自Stroke上发表的一项最新研究，在诱导中风小鼠模型中，使用抗生素预处理可显著降低梗死体积，而抗生素诱导的急性及长期中风保护作用与其诱导产生的特定肠道菌群特征相关。

缺血性中风 AMPICILLIN Bacteroidetes metabolic pathways microbiota

Nature Reviews：如何合理设计基于菌群的免疫疗法（综述）

《Nature Reviews Immunology》上发表的一篇综述文章，系统性介绍了菌群对免疫系统的调节作用，并阐释了设计基于菌群的免疫疗法的两种策略，推荐阅读。

菌群疗法 immunotherapy metabolic pathways microbiota Mucosal immunology

围脂滴蛋白

Microbiome：16S有局限，转录组更宜洞察菌群功能

一项重要的利用基因缺陷小鼠分析饮食对菌群的影响的研究，结果本身似乎在情理之中，但研究者提出的观点值得关注，那就是16S测序研究菌群组成，或许并不能充分体现基因、饮食等因素对菌群功能的影响，而转录组这样的更精细的方法，或许要被更充分重视和应用。

围脂滴蛋白 Lipid uptake metabolic pathways metatranscriptomics Microbiome

FM：盲肠菌群和粪便菌群很不同

绝大多数的“肠道”菌群研究，用的分析样本是粪便，事实上从盲肠到直肠，空间距离很长，菌群也是有区别的，这项研究的结果也证明如此。

gut microbiome metabolic pathways metagenomics Metaproteomics microbial community

MNFR：我们和我们的肠道微生物们

Molecular Nutrition & Food Research 会连续两期发出专刊，第一期主题“肠道菌群”，第二期主题为“全谷物的健康作用”，这是两篇专刊序言，大家先睹为快。

Gut microbiota microbial product metabolic pathways host-microbiome signaling systems multiple-omics approaches