生长速率

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文章数：3篇

呼吸道病毒感染

丁涛团队：呼吸道病毒感染如何塑造口咽菌群？

呼吸道微生物群被认为是呼吸道健康的守门人，病毒感染会破坏其维持的微生物-宿主平衡。然而对于呼吸道病毒感染塑造的呼吸道菌群特征，以及这种塑造是否具有病毒特异性，目前仍不清楚。近日，中山大学中山医学院丁涛及团队在Microbiome发表最新研究，招募了包含735名上呼吸道症状的门诊患者，揭示了不同病毒感染下的口咽菌群表现出三种不同的生态失调模式，同时发现甲型流感病毒与上呼吸道微生物组多样性的变化有关，并提出致病细菌生长速度的增加是流感病毒感染的关键过程，值得关注。

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宏基因组分析方法

基于宏基因组数据对菌群中低丰度细菌的生长速率进行原位测量

与现有的细菌生长速率测定软件相比，GRiD方法既不需要完整的基因组信息，也不需要微生物组成信息。由于其能够在极低测序覆盖度的条件下测量微生物生长速率，所以特别适合分析低丰度物种。点击查看另一个同类工具(http://www.mr-gut.cn/papers/read/1042256665)。

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宏基因组算法

Nature子刊：使用宏基因组数据预测细菌的生长速率

现在关于如何评价环境中细菌生长速率的工具不多，DEMIC 是目前比较突出的一个。

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