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TCGA
文章数:4篇
癌症微生物组
Cell子刊:精确绘制癌症微生物图谱
Cell Host and Microbe近期发表的文章,发现TCGA数据库的测序数据中明显含有污染微生物数据,且与特定的测序中心具有相关性,去除污染物数据后构建癌症微生物图谱TCMA。TCMA可用于鉴定预后相关细菌种类,并为研究宿主-微生物互作进行多组学、泛癌分析提供资源。
癌症微生物组
TCGA
污染物
微生物
肝癌
酒精及HBV调控的肝脏菌群影响肝癌进展
酒精与乙肝病毒(HBV)可协同促进肝细胞癌的发生发展。来自Cancers上发表的一项最新研究发现,HBV和酒精在一个正常的致癌微生物组内作用,促进肿瘤的发展,但也能下调某些致癌微生物。深入了解为什么这些微生物在接触HBV或酒精后下调,以及为什么大多数致癌微生物没有下调,可能对理解肿瘤前肝脏微生物组能否被抑制或逆转以限制癌症进展至关重要。
肝癌
肝细胞癌
研究论文
基础研究
微生物组
结直肠癌
CEACAMs如何促进结直肠癌发生?
最新发表于Gastroenterology的文章研究了癌胚抗原相关细胞粘附分子(CEACAM)家族蛋白间的相互作用。该家族蛋白可与微生物互做,也可与转化生长因子B(TGFB)互做,且在结直肠癌(CRC)细胞中常发生改变。该研究纳入了456例结直肠腺癌(CA)病例及594例来自癌症基因图谱的CRC样本,分析了其DNA测序、mRNA表达水平、患者生存期数据。此外,还使用猎枪宏基因组测序分析了野生型和TGFB信号传导缺陷型小鼠粪便,以确定大肠癌发生前微生物群组成的变化。研究结果支持CEACAM蛋白破坏TGFB信号转导,并改变肠道微生物组构成,促进CRC发生。
结直肠癌
TCGA
Microbiome
signal transduction
tumor suppressor
HER2 mutations
重磅!HER2突变肿瘤靶向治疗并非万能!
该综述回顾了在不同人类癌症中发现的HER2突变的发生率和类型,它们的生化和生物学特性,以及它们在临床前和临床环境中对抗HER2治疗的敏感性。
HER2 mutations
next-generation sequencing (NGS)
Afatinib
Neratinib
TCGA