Metagenomic sequencing

搜索
登录

Metagenomic sequencing

文章数：9篇

寄生虫-菌群互作

Cell子刊：寄生虫选择促进其生命周期的菌群进行肠道定植

土壤传播的肠道寄生虫在全球感染超过15亿人。虽然寄生虫的定植与肠道菌群组成的变化有关，如梭状芽孢杆菌的增加，但具体的单个物种尚未分离和鉴定。Cell Reports近期发表的文章，从马来西亚寄生虫感染高发的土著人群中分离出梭状芽孢杆菌，而这些寄生虫相关的梭状芽孢杆菌则具有促进寄生虫鼠鞭虫和鞭虫生命周期的能力。这就表明，寄生虫选择促进其生命周期的菌群进行肠道定植。

寄生虫-菌群互作 helminth Trichuris clostridia Microbiome

粪菌移植治疗肠易激综合征的效果，反映在菌群的变化上

此前研究表明，粪菌移植（FMT）可改善肠易激综合征（IBS）（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1067002624），但并非对所有患者都有效。Gut Microbes发表了来自同一团队的后续研究，表明FMT可引起患者肠道菌群的长期变化，这些变化反映了治疗的临床效果。

粪菌移植 Irritable bowel syndrome Fecal microbiota transplantation Engraftment Metagenomic sequencing

宿主-菌群互作

生活方式与肠道寄生虫对肠道菌群的影响

非洲人的基因组、表型及文化多样性为研究宿主-菌群共进化及其对适应性表型的影响提供了一个独特的机会。Genome Biology上发表的一项最新研究，通过分析对比不同种群及不同生活方式的喀麦隆人的肠道菌群、肠道寄生虫及免疫指标，发现生活方式及肠道寄生虫的存在显著影响了菌群的组成与多样性，并对宿主免疫应答产生显著影响。

宿主-菌群互作 gut microbiome hunter-gatherers parasites helminths

小柳原田病

杨培增+秦楠等：小柳原田病患者的肠道菌群变化

小柳原田病是一种多系统自身免疫性疾病，以肉芽肿性葡萄膜炎为特征。来自重庆医科大学附属第一医院的杨培增团队与锐翌生物秦楠团队在Gut Microbes上发表的一项最新研究，鉴定出了小柳原田病患者的肠道菌群变化特征，免疫抑制剂治疗后可恢复部分菌群，而菌群失调对眼内炎症可能起到恶化作用。

小柳原田病 gut microbiome Vogt-Koyanagi-Harada (VKH) disease Metagenomic sequencing fecal microbiota transplant

替加环素作用下生物膜反应器中的抗性组变化

在一个周期为636天的实验中，来自于中科院生态环境中心的研究人员通过在合成污水中加入 0-25 mg/L 的替加环素，探索抗生素持续暴露对水处理系统中好氧生物膜群落的结构和抗性组的影响。

抗性组 Dynamics Resistome Biofilm microbiota Tigecycline

百岁老人的菌群组成及功能有何特点？

意大利的撒丁岛以其居民的长寿而闻名。mSystems上发表的一项横断面研究结果，对撒丁岛上的百岁老人的肠道菌群进行了分析，鉴定出了百岁老人的菌群组成及功能特征。

长寿 centenarian Gut microbiota longevity Metagenomic sequencing

AI技术用于宏基因组数据中病毒检测

从宏基因组测序数据集中检测高度不同或未知的病毒是一项重大的生物信息学挑战。本研究分别采用随机森林和神经网络的机器学习方法预测宏基因组序列中的病毒序列，取得了很好的结果。

人工智能机器学习 Human samples machine learning Metagenomic sequencing

粪便样品储存

华大基因：用于室温储存粪便样品的低成本试剂

Microbiome[IF：8.496]发表了来自华大基因团队的最新成果，研发出一种低成本的基于N-溴代正辛烷基吡啶的试剂配方，可用于在室温条件下储存粪便样品2周时间，可用于样品的远距离运输，推荐专业人士参考。

粪便样品储存 Fecal sample Metagenomic sequencing N-octylpyridinium bromide Room temperature storage

sputum microbiome

JBR：通过挥发性有机物预测呼吸道疾病中菌群的定植与感染

呼吸气体包含大量挥发性有机化合物(VOCs)，其组成在各类疾病中有所变化，细菌参与了VOCs的形成，为此通过对VOCs的检测，可以预判呼吸道疾病中菌群的定植与感染，很好的文献，分享给大家。

sputum microbiome cystic fibrosis volatile organic compounds Metagenomic sequencing Mytien Nguyen