Bo-Young Hong

搜索
登录

Bo-Young Hong

文章数：5篇

口腔致病菌“偷取”其他共生菌的生长因子

ISME Journal近期发表的一项研究发现，口腔致病菌牙龈卟啉单胞菌能从早期定植的小韦荣球菌那里获得一种可溶性因子，来帮助自身在低密度条件下生长。

细菌互作口腔致病菌牙龈卟啉单胞菌

仅仅依靠16S rRNA基因可否将微生物图谱描绘到菌株水平？

虽然部分16S rRNA基因区域对微生物的分辨率与全长相当，但仅仅对有限的种群，对于描绘数量庞大微生物群落任然停留在属及以上的水平。Illumina的短读长的测序和过去罗氏454测序都无法得到16S rRNA基因全长序列。Sanger测序可以满足读长的要求，却在通量上远远不够。目前，以Nanopore和PacBio为代表的三代测序技术方兴未艾，让16S rRNA基因全长高通量测序走向现实。高通量测序全部可变区的序列必将改变我们对微生物群落的认识。这是否可以描绘到我们关心的种和菌株水平？本文将给出答案。

扩增子 16S rRNA 基因全长16S 三代测序分类精度

多组学研究

Nature：多组学纵向追踪，揭示糖尿病前期的宿主和菌群特征

大部分糖尿病前期者都会发展为糖尿病，但人们对其相关生理过程和背后的生物学机制，仍所知甚少。《Nature》发表的一项最新研究，对106个健康和血糖调控受损个体进行长达4年随访，对受试者的血液转录组、代谢组、细胞因子和蛋白质组以及肠道和鼻腔微生物组进行多组学的深度纵向分析，在群体和个体层面揭示了稳态和应激状态（如呼吸道病毒感染和接种流感疫苗）下，血糖调控受损和健康者的生理和菌群差异，为糖尿病的早期诊断，以及阐释糖尿病前期的生物学机制，带来启示。该研究中的大部分数据都是开放获取的，值得相关领域研究者特别关注。

多组学研究糖尿病前期 pre-diabetes Prognostic markers Congjiao Sun

化疗诱导的口腔粘膜炎与口腔菌群失调

口腔粘膜炎是化疗的常见副作用之一，《Microbiome》近期发表的一项研究发现，化疗诱导的口腔粘膜炎与口腔细菌群的失调相关，且这种失调可加剧药物诱导的上皮损伤，改善口腔细菌失调或是缓解口腔粘膜炎的新思路。

口腔菌群 Cancer Chemotherapy Microbiome Mucosal-microbial crosstalk

CMR：肺结核和抗结核治疗后的菌群变化（综述）

关于肺结核中的菌群研究有一些，这篇综述承前启后，对相关工作做了很好的总结，还特别对研究肺部菌群的步骤进行了介绍，很值得读一读。

肺结核抗结核治疗肺部菌群呼吸道菌群 Sarah DeWeerdt