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生物大数据
文章数:4篇
宏基因组
Nature子刊:海洋微生物多样性之前被低估了
据估计,20%-80%的海洋微生物以生物膜形式存在(http://www.mr-gut.cn/papers/read/1087827001)。近期《Nature Communications》发表Tara Oceans项目的研究成果,通过对海洋生物膜宏基因组的分析,在生物膜中发现了大量隐藏的生物多样性和功能特征。
宏基因组
生物膜
海洋菌群
海洋生物膜
海洋宏基因组
肿瘤治疗
N−3脂肪酸并不能降低心血管疾病和癌症的发病率
鉴于目前据说鱼油能够减少慢性疾病的发病率,为了探究n−3脂肪酸与心血管疾病和癌症发病率之间的关系,获得大量更准确的数据来评估这些营养品是很有必要的。
肿瘤治疗
n-3脂肪酸
生物大数据
Mirko Trajkovski
Claire Chevalier
随机森林机器学习
对人体菌群样本来源部位的分类准确度提高了35%
得益于一个新的随机森林分类器,在对来自于不同人体部位的菌群样本进行分类时的准确度提高了35%。对菌群大数据的机器学习和应用方兴未艾。
随机森林机器学习
溯源
Biomarkers
Generalized Local Learning
human microbiome
竞争性彩票模型
肠道菌群中存在基于竞争性彩票模型的组装模式
竞争性彩票模型认为来自区域物种池的不同生物群能够在相同的生态位定殖,且第一个到达的物种将占据整个生态位并排除其它群体成员。对于进化关系较近的同一属的细菌来说,因其具有类似的代谢能力,可能更契合这一模型。
竞争性彩票模型
菌群组装
Competitive lottery model
Computational modeling
ecology