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纳米孔
文章数:3篇
宏基因组
王军团队iMeta:分析宏基因组结构变异的新利器——MetaSVs
结构变异(structural variants, SVs,包括大片段的插入、缺失、倒置和易位)显著影响微生物基因组中基因的功能,菌群中的SVs与多种生物过程和人类疾病相关,中科院微生物所王军团队近期在iMeta发表研究,建立了一个整合了Nanopore长reads和Illumina短reads的MetaSVs流程来分析微生物基因组中的SVs,并进一步确定可以反映代谢差异的差异SVs。
宏基因组
菌群
纳米孔
结构变异
杂交测序
纳米孔
纳米孔自适应采样:一种富集宏基因组样本中低丰度物种的方法
对于研究 DNA 分子长度对自适应采样效率和功效的影响,以确定其对宏基因组组装基因组(MAG)和诊断应用的有用性,在本文中,作者提出了一个数学模型,该模型可以在已知的相对丰度和读长长度分布的情况下预测宏基因组群落中可能的富集水平。使用合成落,作者证明模型的预测与观察到的行为密切相关,并量化了采用自适应采样对流动池产量造成的负面影响。
纳米孔
自适应采样
宏基因组学
测序
富集
测序技术
SR:用Nanopore测16S全长,可鉴定出更多种
Nanopore,所谓四代测序,据说最后会做成U盘大小,应用于微生物检测恐怕要带来革命。
测序技术
微生物分类
纳米孔
Matteo Soverini
Marco Candela