Thomas S B Schmidt

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Thomas S B Schmidt

文章数：4篇

Nature子刊：受体而非供体决定粪菌移植后的菌群混居共存？

粪菌移植（FMT）已成为治疗胃肠道相关疾病一种较常见的干预手段，通过转移健康供体的肠道菌群和肠腔内容物，重建受体的肠道菌群生态，达到治疗目的。有观点提出 “超级供体”假说，认为好的供体如同“万能药”，但真的是这样吗？近日欧洲分子生物学实验室Peer Bork在Nature Medicine发表最新研究，通过分析316个FMT临床和宏基因组学数据，发现可能是受体而非供体决定粪菌移植后菌群“混居”状态。深入研究后没有找到强有力证据表明任何菌株天生比其他菌株更具侵略性/复原力。相反，菌群结构和多样性，供体-受体菌群互补性决定了粪菌移植的复原力、共存和定植。该研究的发现一定程度打破了“超级供体”假说，未来还需要更深入探究肠道中真菌、噬菌体等其他微生物在FMT扮演的角色，以便提供更权威的证据。

粪菌移植供体菌群研究论文基础研究超级供体

菌群-免疫互作

PTPN22突变体通过影响菌群调节小鼠结肠炎

非受体型蛋白酪氨酸磷酸酶22（PTPN22）是一种免疫细胞上表达的负向调控因子。Journal of Clinical Investigation上发表的一项最新研究，发现一种与IBD风险降低，但又与自身免疫疾病风险增加相关的非受体型蛋白酪氨酸磷酸酶22（PTPN22）突变体，可抑制急性DSS处理诱导的小鼠结肠炎，但在多次慢性DSS处理后，又可加剧小鼠结肠炎。同时，该效应依赖于PTPN22突变体对肠道菌群的调控。

菌群-免疫互作菌群-免疫互作动物实验非受体型蛋白酪氨酸磷酸酶22（PTPN22）结肠炎

微生物分类

Nature子刊：用单拷贝基因系统发育方法分析OTU

16S rRNA基因用于系统分类学研究的地位已经不稳了。之前就有研究人员通过单拷贝基因构建了新的生命之树（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1087194889），发现有明显优势。《Nature Communications》近期发表研究，又进一步基于新的生命之树开发了mOTUs2菌群分析工具。随着宏基因组测序的不断发展，这种分析方法或许将成为菌群结构分析的标准动作之一，非常值得关注！

微生物分类菌群结构生物信息学工具宏基因组学生物信息学数据库

菌群靶向调节

Cell：从相关性研究到靶向调节菌群（综述）

肠道菌群研究如火如荼，但大多只是相关性研究，转化应用仍在起步阶段。Cell上周发表的这篇综述，提出了向转化性研究迈进的方法，并总结了相关方法学的重要进展，值得关注。

菌群靶向调节相关性研究因果性研究