因果性研究

搜索
登录

因果性研究

文章数：12篇

Nature子刊：研究菌群与疾病，从相关性到因果分子机制的5个层级（综述）

大量研究探索了微生物组与人类疾病之间的关系，但不同的研究提供的证据角度和深度是有差异的。Nature Chemical Biology发表的这篇综述提出，可以从5个层级（从观察相关性到挖掘因果分子机制）对研究证据进行评估，并在这一框架下回顾了多种人类疾病的菌群研究进展，探讨了相关发现的临床转化潜力，值得专业人士参考。

微生物组相关性研究因果性研究分子机制

赵立平等：菌群研究走向因果，回归培养必不可少（Nature Reviews年度回顾）

科赫法则是证明病原体引发疾病的金标准。其中关键的一环是，将分离出的病原体在培养基上养成纯培养，用其感染健康个体后能引发相同的疾病。在菌群研究走向因果和机制的当下，也需要用相同的思路来证实特定的肠道菌群成员与健康或疾病表型的因果关系。Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology最新发表了由美国罗格斯大学、上海交通大学的赵立平主笔的年度回顾文章，重点介绍了今年发表的3项研究（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1078683050）（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1091956818）（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1052230071），这些研究都使用了细菌纯培养来阐释特定肠道细菌对宿主的致病或保护性作用及其生物学机制；并指出，通过对宿主和细菌中的关键基因进行遗传操作以阐明细菌-宿主互作中的分子机制，是菌群因果性研究的重要思路。

肠道菌群细菌培养因果性研究

囊性纤维化

囊性纤维化导致肠道菌群失调

近年来，随着研究的不断深入，人们开始发现机体肠道菌群或与多种人类疾病直接相关。但在宿主遗传学和共生微生物群之间建立因果关系一直很困难。囊性纤维化（cystic fibrosis ，CF）是一种由囊性纤维化跨膜传导调节因子（CFTR）基因突变引起的遗传性疾病，已被证明和肠道菌群失调有关，但CF和肠道菌群失调如何促进疾病进展，以及菌群失调本身的原因尚不清楚。发表在PLoS Pathogens上的一项研究，利用无菌CF小鼠模型，表明导致CF的CFTR基因突变可同时调节宿主适应性免疫反应和肠道菌群，为CFTR在肠道菌群调节中的主导作用提供了新的见解。

囊性纤维化肠道菌群因果性研究 CFTR 无菌小鼠模型

Science：研究肠道菌产物对宿主影响的新利器

肠道菌群可产生大量多样化的生物活性分子，对宿主的生理活动和健康产生影响。然而由于缺乏相应的遗传操纵工具，人们一直难以深入分析特定细菌产物对宿主的影响和作用机制。比如哺乳动物肠道中常见的共生梭菌，就是一类难以进行遗传操纵的细菌。Science最新上线的一项研究报道了一种可对梭菌进行多基因敲除的方法，并通过小鼠定植实验，发现生孢梭菌产生的支链短链脂肪酸对宿主的免疫调控功能。这种方法不仅可研究梭菌等细菌产生的分子对宿主的影响，也可通过编辑特定细菌的基因组，实现对特定菌群产物的调控。

菌群产物梭菌 CRISPR-Cas9 基因编辑短链脂肪酸

菌群研究科学

菌群研究需要精准描述、据实汇报、明确因果！

准确传达菌群相关研究成果需要严谨的思维逻辑和表述方法。《Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology》近期发表评论文章，指出目前菌群研究中存在定义不明确的概念和定量方法的局限性，并强调了非因果性研究成果在指导疾病预防和治疗中存在风险。本文对于开展菌群研究、表述研究成果具有重要参考价值。

菌群研究科学观点评论绝对丰度菌群紊乱因果性研究

生态学原理

赵立平：微生物组大数据分析中的生态学原理分析

上海交通⼤学微生物学特聘教授、美国罗格斯大学应用微⽣物学冠名讲席教授赵立平博⼠，发表题为《微生物组大数据分析中的生态学原理分析》。指出需要用⽣态理论指导菌群研究，重视不同细菌类群间的联系。

生态学原理菌群分析方法物种间互作菌株水平差异因果性研究

菌群靶向调节

Cell：从相关性研究到靶向调节菌群（综述）

肠道菌群研究如火如荼，但大多只是相关性研究，转化应用仍在起步阶段。Cell上周发表的这篇综述，提出了向转化性研究迈进的方法，并总结了相关方法学的重要进展，值得关注。

菌群靶向调节相关性研究因果性研究

一图读懂：菌群-免疫疾病走向因果（Science子刊必读综述）

免疫系统与菌群互相影响、共同进化，大量研究表明肠道菌群的改变与免疫疾病存在密切关联，然而这种关联的因果性仍待研究。本周Science Immunology上线的重磅综述，对近期菌群与免疫性疾病的因果性研究进展进行了回顾，对相关方法技术的优缺点进行了评论，并讨论了存在的挑战和未来发展方向，值得所有研究菌群与疾病的科研人员学习借鉴。

免疫疾病因果性研究

因果性研究

Cell子刊：菌群因果性研究的新方法

这是Cell Host and Microbe[IF：14.946]针对我们之前介绍过的一篇Nature文章（http://www.xunludkp.com/papers/read/1084051336）的介绍，老规矩，这样的文章看看图就会有收获，而今天这图简单明了，说明了确定菌群与疾病因果关系的新方法，很值得特别关注。

因果性研究 David J Lloyd Elizabeth A Killion Jinghong Wang Junming Yie

Nature子刊：多种方法助菌群因果性研究

这是Nature Microbiology针对之前发表在Nature的研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1084051336）的报道，老规矩，这样的文章看看图就会有收获。

共生菌菌群功能因果性研究 Yongguo Li Katharina Schnabl

JP：到底哪些分子介导了肠道细菌与代谢健康？（综述）

很值得关注的一篇综述，介绍LPS、血管生成素样蛋白4、胆汁酸及短链脂肪酸等如何介导肠道细菌与代谢健康，关注肠道菌群对健康、疾病作用分子机制的人值得认真读一读。

代谢疾病因果性研究 adipose tissue inflammation angiopoietin-like protein 4 bile acids

Cell子刊：肿瘤微生物组存在么？

①与癌症发展相关的菌群“肿瘤微生物组”越来越受到关注。 ②虽然一些研究发现了细菌与癌症之间的相关性，但没有确切的证据表明这些细菌直接导致了癌症的发生。 ③要确切地证明癌症相关细菌与癌症的因果性，需要更好的实验设计，比如将癌症相关细菌转移至拥有人源化免疫系统的小鼠体内。

肠道菌群癌症相关性研究因果性研究