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文章数：4篇

肠道微生物

Cell子刊：肠道中细菌和噬菌体共存的机制

Cell Host and Microbe近期发表的文章，对哺乳动物肠道中细菌和噬菌体共存的机制进行探究，发现噬菌体在肠道的空间分布不均匀，形成细菌的空间避难所，从而促进两者的共存。这可能会影响针对肠道病原体的噬菌体治疗的整体疗效。

肠道微生物 microbiota intestinal microbes mucosa Viruses

器官水平蛋白网络可作为微生物的宿主效应的参考

探索微生物群落对宿主影响的机理研究通常是由无菌小鼠完成。《Genome Research》的这篇文章为探索微生物定殖于肠道内外时不同蛋白的作用，使用蛋白质组学的方法分析鉴定小鼠不同器官的蛋白、建立蛋白网络并将其3D视化，使菌群研究者由此深入探究宿主-微生物互作下特定器官和生物体内的变化。

蛋白网络 microbiota Tandem Mass Tags Organ Proteomics gnotobiotic mice

饮食-菌群互作

Cell子刊：肠道细菌或能降解有害食品加工产物

在加热过程中，食物中的氨基酸会与糖结合形成美拉德反应产物（MRP）。MRP广泛存在各种加工食品中，可分为早期MRP（如：ϵ-果糖赖氨酸（FL））和晚期MRP（又称晚期糖基化终末产物（AGE）），其中AGE对健康的不良影响已被很多研究证实。Jeffrey Gordon团队在Cell Host and Microbe发表的一项最新研究发现，在人源化限菌小鼠中，FL能选择性地增加肠道柯林斯菌（Collinsella intestinalis）的绝对丰度，诱导FL利用基因的表达，从而将FL代谢为无毒产物。这些发现意味着，食物中的一些潜在有害物质或许能被特定肠道细菌“解毒”，为减少加工食品的危害、增强食品安全，带来新启示。

饮食-菌群互作 processed foods Maillard reaction products human gut microbiome Collinsella species

gut microbiota–immune cell interactions

PNAS：肠道菌群改变肠上皮淋巴细胞的表观遗传

肠道菌群如何影响宿主基因的表达，这是个很重要的问题，PNAS上这篇文献必须值得大家看看。

ATAC-seq enhancers of gut intraepithelial lymphocytes gnotobiotic mice gut microbiota–immune cell interactions transcription factors